| Project/Area Number |
20J23792
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 国内 |
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| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
森田 真梨 (2020-2021) 京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)
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| Research Fellow |
森田 真梨 (2022) 京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)
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| Project Period (FY) |
2020-04-24 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2020: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
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| Keywords | KIR / アレル多型 / 同種造血幹細胞移植 |
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| Outline of Research at the Start |
造血器腫瘍に対する同種移植のドナーはHLA多型の適合性により選定されるが、合併症や再発は依然課題で、新規パラダイムの導入が必要である。キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)多型は、NK細胞免疫を規定し予後に関与する可能性があるが、既報の結果は一定せず、アリル多型に踏み込んだ解析は乏しい。次世代シークエンサーによる高精度全自動化KIRアリルタイピング法を開発し、本邦の移植ドナーとレシピエントの保存試料とレジストリデータを用いて、予後因子となるKIRアリル多型を抽出する。同多型の免疫学的機能を基礎的実験で検証する。以上より、KIR/HLAアリル多型に基づく新規ドナー選定アルゴリズムを提示する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
Killer cell immunoglobulin-like receptor(KIR)はNK細胞受容体の一つで、Human Leukocyte Antigen(HLA)と会合しNK細胞の機能を調整する。KIR遺伝子領域は19番染色体にあり、全部で17遺伝子座からなる。遺伝子座の構成が異なるKIRハプロタイプが複数存在するため、KIR領域はアレル多型に加えてコピー数多型を持つ。同種造血幹細胞移植ではKIRとHLAのアレルの組み合わせが両者の会合親和性を規定しNK細胞免疫を調節すると考えられるが、正確なタイピング手法が確立しておらず、バイオマーカーとしての開発が困難であった。
2020年度は全ゲノムシークエンス(Whole genome sequencing, WGS)データを用いて全17KIR遺伝子のコピー数とアレル、ハプロタイプの推定法と融合遺伝子検出法を開発した。昨年度から今年度にかけては、日本人約2,000人のWGSからKIRハプロタイプを決定し、その情報をもとに、15種類の機能性KIR遺伝子それぞれに対して全長を増幅するPCRプライマーの配列を選定した。KIR遺伝子型を決定した日本人サンプルを陽性コントロールとして検証した結果、日本人の主要なハプロタイプでは高感度に各KIR遺伝子を増幅できた。さらに、ロングリードシーケンサーに対応した実験手法およびKIRアレルタイピング手法を開発し、低コストでKIR全長配列を正確に得ることができるようになった。開発手法により成人T細胞白血病に対する非血縁骨髄移植264例のドナー・レシピエントのKIRアレルタイピングを行なった。現在、KIR/HLAのアレル・アミノ酸多型と予後との網羅的な関連解析を行なっている。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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