• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Exploration of the novel function of the ribosome in tolerance to chronic DNA damage stress

Research Project

Project/Area Number 20K05790
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionGakushuin University

Principal Investigator

Genki Akanuma  学習院大学, 理学部, 助教 (30580063)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywordsリボソーム / Ribosome / Saccharomyces cerevisiae / Genome stability / リボソームタンパク質 / サプレッサー / 染色体異数化 / DNA損傷ストレス耐性
Outline of Research at the Start

生物は自然環境中に存在する様々なDNA損傷ストレスに対抗するため、DNA損傷ストレス耐性能を獲得してきた。これまでの研究から、自然環境に近い低レベルかつ慢性的なストレスと、急性的な損傷ストレスに対する細胞の適応戦略は異なることが示されてきた。また、リボソームの翻訳活性制御がストレス耐性に関与することも分ってきた。そこで本研究では、出芽酵母のリボソームタンパク質や翻訳制御因子に着目したプロテオーム解析と遺伝的スクリーニング法を用いて、低レベルかつ慢性的な紫外線ストレスの耐性に関与する因子を探索し、DNA損傷ストレス耐性における役割を解明する。

Outline of Final Research Achievements

Investigation of the effects of DNA damage stress on the ribosomes of budding yeast showed that DNA damage stress reduces the translational activity of ribosomes and that under DNA stress conditions there may be ribosomal proteins that are replaced by paralogous proteins. In addition, deletion mutant of ribosomal protein gene recovered their growth rate by aneuploidy of the chromosome encoding the paralog protein, thereby reducing their DNA damage stress tolerance. In addition, it was found that ribosomal protein deficiency increases the susceptibility to chromosomal partitioning abnormalities, resulting in an increased frequency of suppressor mutant strains.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、DNA損傷ストレスがリボソームの活性や複合体の構成に影響を与えることが明らかになった。この成果はこれまであまり注目されていなかったリボソームとゲノム安定性との関係を示すものであり、新たな研究分野に発展する可能性を秘めている。また、リボソームタンパク質の欠損が染色体分配異常を引き起こすとともに、パラログ遺伝子の重複により細胞内翻訳活性を補完するという新たな発見は、染色体恒常性維持にリボソームが重要な役割を果たすことを示すとともに、異数化による遺伝子機能相補の一般性を示唆するものである。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Diploid-associated adaptation to chronic low-dose UV irradiation requires homologous recombination in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>2022

    • Author(s)
      Shibata Mana、Keyamura Kenji、Shioiri Takuya、Noda Shunsuke、Akanuma Genki、Hishida Takashi
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: 222 Issue: 1

    • DOI

      10.1093/genetics/iyac115

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolution of Ribosomal Protein S14 Demonstrated by the Reconstruction of Chimeric Ribosomes in Bacillus subtilis2021

    • Author(s)
      Akanuma Genki、Kawamura Fujio、Watanabe Satoru、Watanabe Masaki、Okawa Fumiya、Natori Yousuke、Nanamiya Hideaki、Asai Kei、Chibazakura Taku、Yoshikawa Hirofumi、Soma Akiko、Hishida Takashi、Kato-Yamada Yasuyuki
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 203 Issue: 10 Pages: 0-0

    • DOI

      10.1128/jb.00599-20

    • Related Report
      2021 Research-status Report 2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Diverse relationships between metal ions and the ribosome2021

    • Author(s)
      Akanuma Genki
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 85 Issue: 7 Pages: 1582-1593

    • DOI

      10.1093/bbb/zbab070

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Conserved Histone H3-H4 Interface Regulates DNA Damage Tolerance and Homologous Recombination during the Recovery from Replication Stress2021

    • Author(s)
      Hayashi Masafumi、Keyamura Kenji、Yoshida Asami、Ariyoshi Mariko、Akanuma Genki、Hishida Takashi
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 41 Issue: 4

    • DOI

      10.1128/mcb.00044-20

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Magnesium depletion extends fission yeast lifespan via general amino acid control activation2021

    • Author(s)
      Ohtsuka Hokuto、Kobayashi Mikuto、Shimasaki Takafumi、Sato Teppei、Akanuma Genki、Kitaura Yasuyuki、Otsubo Yoko、Yamashita Akira、Aiba Hirofumi
    • Journal Title

      MicrobiologyOpen

      Volume: 10 Issue: 2 Pages: 1176-1176

    • DOI

      10.1002/mbo3.1176

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 大腸菌RecNによる核様体の再構築と細胞内局在の観察2022

    • Author(s)
      野田俊輔, 仁木杏樹, 毛谷村賢司, 赤沼元気, 菱田卓
    • Organizer
      日本遺伝学会 第94回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母mgs1過剰発現ライブラリーを用いたMgs1の機能解析2022

    • Author(s)
      松本彩花, 赤沼元気, 菱田卓
    • Organizer
      日本遺伝学会 第94回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 低線量率の紫外線環境下で働くDNA損傷応答経路の定量的解析2022

    • Author(s)
      島田遼, 赤沼元気, 菱田卓
    • Organizer
      日本遺伝学会 第94回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 野田俊輔, 仁木杏樹, 毛谷村賢司, 赤沼元気, 菱田卓2022

    • Author(s)
      大腸菌SMC様タンパク質RecNによる断片化した核様体の再構築過程
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi