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Pyrophosphate-Mediated Regulation of Plant Metabolism and Its Application in Modifying Plant Functions

Research Project

Project/Area Number 20K05826
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

Segami Shoji  基礎生物学研究所, 生物進化研究部門, 助教 (00765935)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsピロリン酸 / 液胞 / プロトンポンプ / ピロホスファターゼ / 糖代謝 / デンプン / 窒素 / 液胞輸送 / 重力
Outline of Research at the Start

植物の液胞膜に2つ存在するH+輸送体のうち、ゴミであるピロリン酸(PPi)を用いるV-PPaseはエネルギー節約型のポンプと考えられてきたが、これはPPiの濃度を調節するために重要であることが分かってきた。この研究ではPPiは植物の成長調節物質であり、V-PPaseの量がPPiの濃度調節を介して糖の使われ方(成長・供給/貯蔵)を決めているという仮説を検証する。
また、PPiを単純に分解除去するsPPaseを植物で働かなくすることで、ポンプでもあるV-PPaseのみがPPiを優先的に使える環境をつくることで、液胞にものを溜める力を強化させた改変植物の作出を目指す。

Outline of Final Research Achievements

We verified that plants maintain optimal pyrophosphate concentrations in different tissues by utilizing two types of hydrolytic enzymes, V-PPase and sPPase, selectively. In columella cells at the root apex, ectopic expression of V-PPase led to a reduction in starch and enlargement of vacuoles, a phenomenon also observed in mutants lacking H+ transport activity. This suggests a physiological significance in maintaining low V-PPase expression for functional integrity. Regarding the enhanced V-PPase deficiency phenotype in aerial parts when NH4+ was not used as a nitrogen source, it was determined that no other hydrolytic enzymes besides V-PPase and sPPase were involved, and there were no changes in their expression levels. However, identifying the pathway of PPi production in the aerial parts remains unresolved and is a subject for future research.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

V-PPaseは液胞膜においてH+を輸送するポンプであり、その過剰発現により植物に有益な形質を付与することが多数報告されている。しかし、ピロリン酸の濃度を決定する因子であることも近年判明しており、その機能の本質的な理解はまだ十分ではない。本研究ではV-PPaseが例外的に少ない根端コルメラに注目し、V-PPase高発現がH+輸送活性の有無に依らず悪影響を及ぼす例を示した。当初の仮説を否定する結果も得られておりピロリン酸蓄積との関係を議論するにはさらなる解析が必要だが、コルメラの機能維持のための液胞膜タンパク質発現制御という側面を見出した。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 2020

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] The Arabidopsis katamari2 Mutant Exhibits a Hypersensitive Seedling Arrest Response at the Phase Transition from Heterotrophic to Autotrophic Growth2023

    • Author(s)
      Hosokawa Chika、Yagi Hiroki、Segami Shoji、Nagano Atsushi J、Koumoto Yasuko、Tamura Kentaro、Oka Yoshito、Matsushita Tomonao、Shimada Tomoo
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 65 Issue: 3 Pages: 350-361

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad156

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transcriptional activation of auxin biosynthesis drives developmental reprogramming of differentiated cells2022

    • Author(s)
      Sakamoto Yuki、Kawamura Ayako、Suzuki Takamasa、Segami Shoji、Maeshima Masayoshi、Polyn Stefanie、De Veylder Lieven、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 34 Issue: 11 Pages: 4348-4365

    • DOI

      10.1093/plcell/koac218

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Lack of Vacuolar H+ -Pyrophosphatase and Cytosolic Pyrophosphatases Causes Fatal Developmental Defects in Arabidopsis thaliana2020

    • Author(s)
      Fukuda Mayu、Mieda Marika、Sato Ryosuke、Kinoshita Satoru、Tomoyama Takaaki、Ferjani Ali、Maeshima Masayoshi、Segami Shoji
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 11 Pages: 655-655

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.00655

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 食虫植物モウセンゴケの運動を制御する高速電気シグナルの解析2023

    • Author(s)
      瀬上 紹嗣、 Gergo Palfalvi、 棚瀬 邦明、 松田 陸玖、 Peng Chen、 須田 啓、 下村 拓史、 大井 祥子、 豊田 正嗣、 長谷部 光泰
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Electrical and Ca2+ Signal Transductions Controlling the Tentacle Movement of the Carnivorous Plant Drosera rotundifolia2023

    • Author(s)
      Shoji Segami
    • Organizer
      19th International Workshop on Plant Membrane Biology 2023
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 食虫植物モウセンゴケにおける高速カルシウムシグナル伝達2022

    • Author(s)
      瀬上 紹嗣,Palfalvi Gergo, 棚瀬 邦明,下村 拓史,陳 鵬,松田 陸玖,須田 啓,張 列弛,大井 祥子,真野 弘明,重信 秀次,豊田 正嗣, 長谷部 光泰
    • Organizer
      日本植物学会 第86回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 食虫植物の活動電位を介した長距離情報伝達2022

    • Author(s)
      瀬上 紹嗣、Gergo Palfalvi、陳 鵬、棚瀬 邦明、下村 拓史、松田 陸玖、須田 啓、張 列弛、大井 祥子、真野 弘明、山口 勝司、重信 秀次、豊田 正嗣、長谷部 光泰
    • Organizer
      第 95 回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 植物におけるピロリン酸と窒素代謝の関係を探る2020

    • Author(s)
      福田茉由、三枝毬花、佐藤良介、木下悟、巴山貴晶、Fanny Bellegarde、Ali Ferjani、前島正義、瀬上紹嗣
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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