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Distribution of novel nitro group-forming enzymes in plants and structures involved in substrate recognition

Research Project

Project/Area Number 20K05861
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
Research InstitutionToyama Prefectural University (2021-2022)
University of Tsukuba (2020)

Principal Investigator

Takuya Yamaguchi  富山県立大学, 工学部, 助教 (00748527)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsビワ / ニトロ基合成酵素 / シトクロムP450 / 脂肪酸水酸化酵素 / CYP94A / 植物特化代謝物 / ウメ / ニトロ化合物 / プロミスキュイティ / 2次代謝
Outline of Research at the Start

植物が生合成する二次代謝産物は莫大な構造多様性を有している化合物群である。しかしニトロ基を含む天然物は非常に少なく、植物のニトロ基合成酵素は未解明であった。ビワの花から見出した新規シトクロムP450 (CYP-NO2) はフェニルアセトアルドキシムを(2-ニトロエチル)ベンゼンに変換する新規ニトロ基合成酵素である。だが、CYP-NO2オルソログは双子葉植物に広く保存されており、脂肪酸ω水酸化酵素として知られていた。そこで本研究では、CYP-NO2とビワ以外の植物由来CYP-NO2の脂肪酸ω水酸化活性とニトロ基合成活性を検出し、さらにCYP-NO2の基質認識に関与する構造を解明する。

Outline of Final Research Achievements

Plants biosynthesize numerous numbers of plant specialized metabolites, but few contain nitro groups. We have discovered a novel nitro group forming enzyme CYP94A90 from loquat. CYP94A family members are widely distributed in dicot plants and some of them have been characterized as fatty acid hydroxylases. In this study we evaluated fatty acid hydroxylase activity and nitro group-forming activity of CYP94A from loquat and other plants. Our results demonstrated that CYP94As are “promiscuous” fatty acid hydroxylase, catalyzing the formation of nitro groups from aldoximes, and are widely distributed in dicot plants. In addition, CYP94A exhibited a higher affinity for fatty acids than aldoxime. Thus, CYP94A was thought to catalyze nitro group synthesis reactions under special conditions in which aldoxime accumulates at high concentrations.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

希少な天然物の生合成酵素は、進化の過程で特定の反応を触媒するように最適化され、特定の種だけが有している場合が多い。しかし、本研究では植物に広く存在している酵素が特定の条件で本来の機能とは異なる酵素活性を発揮し、極めて珍しい化合物の生合成に関わることを示唆した。植物特化代謝物の多様化機構の新たな側面を提示した点で学術的意義がある。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] A promiscuous fatty acid ω‐hydroxylase CYP94A90 is likely involved in biosynthesis of a floral nitro compound in loquat (Eriobotrya japonica)2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Takuya、Matsui Yumi、Kitaoka Naoki、Kuwahara Yasumasa、Asano Yasuhisa、Matsuura Hideyuki、Sunohara Yukari、Matsumoto Hiroshi
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 3 Issue: 3 Pages: 1157-1170

    • DOI

      10.1111/nph.17441

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ビワの花におけるフェニルアセトニトリル生合成に関わるCYP77Aの同定と性状解析2023

    • Author(s)
      野村拓矢, 山口拓也, 浅野泰久
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 動植物のアルドキシムを介したニトリルやニトロ化合物の代謝に関する研究2023

    • Author(s)
      山口拓也
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ビワのニトロ化合物生合成に関わるpromiscuousな脂肪酸水酸化酵素CYP94A90の発見2022

    • Author(s)
      山口拓也
    • Organizer
      日本農芸化学会 中部支部 第194回 例会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ビワの花香成分(2-ニトロエチル)ベンゼンの生合成に関わるCYP94A90の同定と性状解析2022

    • Author(s)
      山口拓也, 浅野泰久
    • Organizer
      令和4年度 内外環境応答・代謝酵素研究会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ビワの花におけるフェニルアセトニトリル生合成に関わるCYP77Aの同定と性状解析2022

    • Author(s)
      野村拓矢, 山口拓也, 浅野泰久
    • Organizer
      令和4年度 内外環境応答・代謝酵素研究会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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