Functional mechanism of an unstructured protein DN3, one of the effectors of a plant pathogen
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20K06049
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 39040:Plant protection science-related
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| Research Institution | Japan Advanced Institute of Science and Technology |
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Principal Investigator |
OHKI Shinya 北陸先端科学技術大学院大学, ナノマテリアルテクノロジーセンター, 教授 (70250420)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
五十棲 規嘉 北陸先端科学技術大学院大学, ナノマテリアルテクノロジーセンター, 研究員 (30804512)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | エフェクター / 相分離 / 天然変性タンパク質 / 液液相分離 / 機能 / 構造 / 相互作用 / NMR |
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| Outline of Research at the Start |
植物病原糸状菌の一種であるウリ類炭疽病菌が植物に感染する際に働くエフェクターの1つであるDN3の作用機序を解明する。DN3の標的探索や相互作用解析などの構造機能相関を調べる分子生物学・構造生物学のスタンダードな実験に加え、状態機能相関に着目してDN3の液滴（ドロプレット）化を調べる実験も行う。さらにはこれを拡張し、細胞内でのDN3の局在に関しても実験的に情報を得る。多階層の時間・空間分解能で研究を展開し、構造・状態・機能の3つの相関に基づいてDN3の働きを分子レベルで明らかにする。
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| Outline of Final Research Achievements |
This project had been focusing on the structure and function of DN3, one of the effector molecules of cucurbitaceous plant pathogens. Particularly, we focused on whether DN3, which is known as IDP (intrinsically disordered protein), undergoes liquid-liquid phase separation, and investigated its properties. The results of NMR and SEM showed that DN3 forms droplets (droplets). Moreover, we obtained information about the size of these droplets. in addition, the MS results provided candidates of the target molecules.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
世界的な人口増加による食糧不足を解決するために基礎研究が貢献できる分野のひとつが、植物の感染病のメカニズムの解明である。本課題では、ウリ科植物病原菌が分泌する感染原因タンパク質のひとつに着目し、その分子の構造や性質から機能を解明しようと試みた。
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Report
(3 results)
Research Products
(4 results)
