Determining the transcriptional network and genome editing to create a novel cellulolytic bacterial strain for biofuels refinery
| Project/Area Number |
20K06139
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 40010:Forest science-related
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | 昆虫共生放線菌 / 植物バイオマス分解 / 転写制御ネットワーク / ゲノム編集 / 植物バイオマス分解性放線菌 / 転写制御因子 / バイオマス分解性放線菌 / マンナン分解酵素 / セルロース分解酵素 / マンノオリゴ糖応答性転写因子 / マンナン応答性転写調節因子 / プロテオミクス解析 / 木質分解性細菌 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、植物バイオマス分解性放線菌の植物バイオマス分解能力を制御する転写制御メカニズムを解明する。本研究で明らかにする予定のセルロース応答性、およびヘミセルロース応答性の転写制御因子については、対象放線菌ゲノムをターゲットにゲノム編集を行い、恒常的にセルロース分解酵素やヘミセルロース分解酵素を分泌する新規植物バイオマス分解細菌の作出し、生化学的手法およびプロテオミクス解析法により、評価する。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, we aim to develop the plant biomass decomposition ability of the strain Streptomyces sp. SirexAA-E by discovering the transcriptional network that response available plant biomass constituent in the growth media.Furthermore, we developed the genome-editing technology to this strain.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究で明らかにした植物バイオマス分解性放線菌における植物細胞壁成分応答性転写制御メカニズムは、これまで報告されていない植物細胞壁マンナン糖質に応答する新たな転写調節因子を解明し、さらに確立した本菌におけるゲノム編集技術は、転写制御メカニズムを理解した上で、新規放線菌株作出を可能にした。これらの知見と技術は、当該分野における学術的意義にとどまらず、未来の植物バイオマス資源を利用した持続可能エネルギー生産技術の基盤となりえるため、社会的意義も大きい。
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Report
(4 results)
Research Products
(12 results)
