Studies on diversity of Flavobacterium psychrophilum from Oncorhynchus keta fry as revealed by Multilocus Sequence Typing and their phenotypes
Project/Area Number |
20K06212
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 40030:Aquatic bioproduction science-related
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Research Institution | Kitasato University |
Principal Investigator |
Kasai Hiroaki 北里大学, 海洋生命科学部, 特任教授 (00221870)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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Keywords | シロサケ / 健苗生産 / 冷水病菌 / 遺伝的多様性 / バイオフィルム / 細菌性冷水病菌 / シロサケ稚魚 / 多座位遺伝子タイピング / MLST / MLST解析 / サケマス増養殖 |
Outline of Research at the Start |
冷水病の原因細菌であるFlavobacterium psychrophilumは、国内外でのアユやサケ科魚類の増養殖業における健苗生産の障害となってきた。最近岩手県内のサケマス孵化場では感染が常態化しているが、シロサケ稚魚に感染する冷水病菌については未解明の部分が多い。そこで、シロサケ種苗及びその周辺環境から冷水病菌を分離培養し、それらの遺伝子型及び表現型の情報を収集しシロサケ稚魚由来冷水病菌の同定基盤を構築する。岩手県のサケマス孵化場及びその周辺環境から冷水病菌株を分離培養し、7座位の遺伝子情報及び感染性等に関連する表現型情報に基づいて国内外の冷水病菌と比較すると共にデーターベース化する。
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Outline of Final Research Achievements |
Chum salmon is an important species for coastal fisheries in Hokkaido and Sanriku area, Japan. However, studies on the genetic diversity of Flavobacterium psychrophilum are limited. We isolated 131 strains of 20 species from the gills, body surface, and kidney of juveniles that showed frail swimming at a salmon hatchery in Iwate Prefecture. Among them, 16 strains were identified as F. psychrophilum, and genetic diversity was analyzed by Multi-Locus Sequence Typing based on 7 kinds of genes. As a result, five strains showed novel genotypes. In addition, cold water disease was detected in the white salmon larva breeding tank by the PCR method, and a high concentration of F. psychrophilum was detected on the surface layer of the larval fish bed and the eggs infected with the mold. A phenotypic comparison of the newly isolated strains revealed the ability to adhere to hydrophobic surfaces. Hydrophobic surface-adhering strains may form biofilms in juvenile rearing environments.
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
シロサケは北海道と岩手県を中心に年間14億尾以上の稚魚がサケ孵化場で生産放流されている最重要魚種であるにも関わらず、健康な放流種苗の生産に影響する冷水病の原因菌種についての系統的な遺伝子型の解析例はなかった。岩手県水産技術センターでは、海況が変動する中でも母川回帰する頑健な稚魚の生産するために、県内のさけます孵化場における放流用稚魚の飼育の履歴を詳細に調査し、冷水病の発生状況についても実態を把握している。我々は、冷水病菌及びその類縁菌の解析結果をデーターベースに蓄積すると共に生産現場にフィードバックすることによって、東日本大震災津波被災以前から低迷している親魚の回帰率向上に貢献する。
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Report
(4 results)
Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Marihabitans2021
Author(s)
Kasai H, Takahashi Y
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Journal Title
Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria
Volume: -
Pages: 1-5
DOI
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Peer Reviewed
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