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Gene expression regulation in hibernating chipmunks for elucidating cold tolerance mechanisms in peripheral tissues

Research Project

Project/Area Number 20K06447
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 42030:Animal life science-related
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

Tsukamoto Daisuke  北里大学, 理学部, 助教 (50598836)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords冬眠 / シマリス / 肝臓 / 遺伝子発現制御 / 体温変動
Outline of Research at the Start

冬眠哺乳動物シマリスの冬眠期は、5℃の冬眠と、37℃の中途覚醒を繰り返しているにも拘わらず全身の健全性が維持されている。近年、冬眠の制御は、非冬眠哺乳動物にも共通に存在する特定の遺伝子の発現様式を調整することで行われているのではないかと考えられるようになってきた。そこで本研究では、冬眠期の遺伝子発現は、冬眠-中途覚醒の体温変動を利用して非冬眠期の概日性の遺伝子発現制御機構を再調整することで制御されているというモデルを検証することから、肝臓が低温で健全な状態を保つ分子機構の解明を目指す。そして、移植医療用臓器不足の根本原因である、臓器保存技術の開発に貢献したい。

Outline of Final Research Achievements

Mammalian hibernation is thought to be controlled by the readjustment of common genes' expression and functions for hibernation, as no genes or proteins specific to hibernating mammals have been discovered. This study tested the model that gene expression during hibernation is regulated by readjusting the mechanisms of circadian gene expression control from non-hibernating periods using the temperature variations between deep torpor and interbout arousals. The main achievement was the establishment of an RNA-seq data analysis environment for chipmunks, which lack reference data. Although this research did not lead to the identification of distinctive gene groups, it has created an important foundation for future research.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

小型冬眠哺乳動物シマリスの体温は、冬眠期には、約6℃にまで低下する約6日間の深冬眠と、約37℃に急激に上昇し覚醒する約1日の中途覚醒を繰り返している。なぜ冬眠哺乳動物が冬眠期の低体温でも全身の健全性が維持されているのかは学術的にもそして医療応用の点から社会的にも重要な謎である。本研究成果が、これまで誰も行ってこなかったシマリスでの遺伝子発現の網羅的解析の端緒となることで、新たな知見の獲得につながるものと期待される。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 5 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] シマリスの冬眠 : 遺伝子発現制御の解析から紐(ひも)を解く2024

    • Author(s)
      塚本大輔
    • Journal Title

      Milsil : 自然と科学の情報誌

      Volume: 17 Pages: 12-14

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Promoter generation for the chimeric sex-determining gene <i>dm-W</i> in <i>Xenopus</i> frogs2023

    • Author(s)
      Hayashi Shun、Tamura Kei、Tsukamoto Daisuke、Ogita Yusaku、Takamatsu Nobuhiko、Ito Michihiko
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 98 Issue: 2 Pages: 53-60

    • DOI

      10.1266/ggs.22-00137

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • Year and Date
      2023-04-01
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular biological studies on hibernation in chipmunks (Tamias asiaticus), a mammalian hibernator2023

    • Author(s)
      塚本 大輔、高松 信彦
    • Journal Title

      低温科学

      Volume: 81 Pages: 119-129

    • DOI

      10.14943/lowtemsci.81.119

    • ISSN
      1880-7593
    • Year and Date
      2023-03-20
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Heat shock factor 1 induces a short burst of transcription of the clock gene Per2 during interbout arousal in mammalian hibernation2023

    • Author(s)
      Takamatsu Nobuhiko、Shirahata Yuiho、Seki Kota、Nakamaru Erina、Ito Michihiko、Tsukamoto Daisuke
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 299 Issue: 4 Pages: 104576-104576

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.104576

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Neofunctionalization of a Noncoding Portion of a DNA Transposon in the Coding Region of the Chimerical Sex-Determining Gene <i>dm-W</i> in <i>Xenopus</i> Frogs2022

    • Author(s)
      Hayashi Shun、Suda Kosuke、Fujimura Fuga、Fujikawa Makoto、Tamura Kei、Tsukamoto Daisuke、Evans Ben J、Takamatsu Nobuhiko、Ito Michihiko
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 39 Issue: 7

    • DOI

      10.1093/molbev/msac138

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Gene expression regulation during hibernation using body temperature fluctuations in the mammalian hibernator chipmunk2021

    • Author(s)
      塚本 大輔、高松 信彦
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 93 Issue: 6 Pages: 830-834

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2021.930830

    • NAID

      40022783954

    • ISSN
      0037-1017
    • Year and Date
      2021-12-25
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] シマリスの冬眠に伴う低温誘導 RNA 結合タンパク質 Rbm3 遺伝子の発現増加機構の解析2023

    • Author(s)
      坂部寧々、米山美羽、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、塚本大輔
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] シマリスの冬眠の低体温に伴う Rbm3 遺伝子の発現制御機構と機能の解析2022

    • Author(s)
      塚本 大輔、坂部 寧々、関 皓太、白畠 由比穂、中丸 絵莉奈、伊藤 道彦、高松 信彦
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 冬眠に伴うストレス応答遺伝子 GADD45A の FOXO1 による転写活性化機構の解明2022

    • Author(s)
      白畠 由比穂、関 皓太、中丸 絵莉奈、岡村 瑠美、塚本 大輔、伊藤 道彦、高松 信彦
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスの肝臓の末梢時計の発現制御の解析2022

    • Author(s)
      関 皓太、白畠 由比穂、中丸 絵莉奈、塚本 大輔、伊藤 道彦、高松 信彦
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスの肝臓における CREB1 バリアントの発現及び機能解析2022

    • Author(s)
      中丸 絵莉奈、安達 めぐみ、白畠 由比穂、関 皓太、塚本 大輔、伊藤 道彦、高松 信彦
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 性&種多様性ワンダーランド:遺伝子間競合(新・性決定遺伝子の下克上)&異種ゲノム間競合2022

    • Author(s)
      伊藤 道彦、林 舜、荻田 悠作、須田 皓介、奥山 ほのか、塚本 大輔、田村 啓、三浦 郁夫、高松 信彦
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスのmiR-182-5pによる時計遺伝子CLOCKの発現制御の解析2021

    • Author(s)
      関皓太、白畠由比穂、塚本大輔、伊藤道彦、高松信彦
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスのmiR-182-5pによるFOXO1の発現制御とFOXO1による GADD45Aの転写制御の解析2021

    • Author(s)
      白畠由比穂、関皓太、岡村瑠美、塚本大輔、伊藤道彦、高松信彦
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ツメガエル生殖巣形成におけるRSPO1リガンドによる雌化機構~生殖細胞を介した雌デフォルト説~2021

    • Author(s)
      佐久間恵吾、中西晋也、田村啓、林舜、荻田悠作、塚本大輔、高松信彦、伊藤道彦
    • Organizer
      第45回日本皮革内分泌学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Impact of body temperature rhythm on gene expression during hibernation in the liver of chipmunk2020

    • Author(s)
      塚本大輔、伊藤道彦、高松信彦
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 収斂重複型性決定遺伝子 ツメガエル dm-W とメダカ dmy の分子進化:下剋上進化仮説の検証に向けて2020

    • Author(s)
      藤村楓雅、荻田悠作、林舜、塚本大輔、田村啓、高松信彦、伊藤道彦
    • Organizer
      第22回日本進化学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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