• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

The role of GARP complex as a multi-functional regulator for the mammalian embryogenesis

Research Project

Project/Area Number 20K06453
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 42030:Animal life science-related
Research InstitutionHyogo Medical University (2022-2023)
Institute of Physical and Chemical Research (2020-2021)

Principal Investigator

Sugimoto Michihiko  兵庫医科大学, 医学部, 准教授 (10373317)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田夛 祐喜  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 開発研究員 (10746382)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsマウス / 初期発生 / 細胞内小胞輸送 / 胚性致死 / 多能性幹細胞 / scRNA-seq / 哺乳動物 / 発生 / 細胞内小胞因子 / 細胞間相互作用
Outline of Research at the Start

申請者のこれまでの研究より、細胞内小胞輸送に関わるタンパク複合体、GARP complexが、哺乳類の発生に必須であることが明らかとなった。また、GARP complexはその構成因子を入れ替えることで、哺乳類杯発生を多面的に制御する多機能発生制御因子としての役割を果たしていることを示唆する結果を得た。本研究では、GARP complex変異マウス胚を用いて単一細胞トランスクリプトーム解析を行うことで、GARP complexが関与する発生制御機構を明らかにし、細胞内小胞輸送経路に関わるGARP complexがいかにして細胞間相互作用を介して哺乳類発生に関与しているのかを解明する。

Outline of Final Research Achievements

Vps52 (a gene coding a component of GARP complex) deficient mouse embryos die just after implantation. Knockout mouse embryos deleting each gene coding proteins associating with VPS52 show lethality during embryogenesis, and genes are classified into three groups according to the timing of embryonic lethality; (1) die just after implantation similar to Vps52 deficient embryos (3 genes including Vps52), (2) die 1 day later than Vps52 deficient embryos (2 genes), and die at mid gestation (1 gene). By scRNA-seq analysis with knockout embryos of early lethal mutant mice, we identified that genes relating ferroptosis, one of programed cell death mechanisms, were affected by deletion of those genes during early embryogenesis. These results suggest GARP complex may regulate the ferroptosis.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

GARP complexは細胞内小胞輸送に関わることが示されているが、その生物学的役割についてはほとんど解明されていない。本研究により、思いがけずGARP complexが哺乳類初期発生過程においてプログラム細胞死の1種であるフェロトーシス制御に関与する可能性を示唆する結果が得られた。フェロトーシスは新しく発見されたプログラム細胞死機構であり、そのメカニズムや生物学的意義は明確ではないが、様々な疾患との関連性や新たな抗がん剤の開発など、医学研究分野でも注目されている。本研究成果はGARP complexそのものの機能解明のみならずフェロトーシス機構を理解する一助となる可能性がある。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Universal surface biotinylation: A simple, versatile and cost-effective sample multiplexing method for single-cell RNA-seq analysis2022

    • Author(s)
      Sugimoto M, Tada Y, Shichino S, Koyamasu S, Tsumaki N, Abe K
    • Journal Title

      DNA Res

      Volume: 29 Issue: 3

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac017

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Human iPS cell-derived cartilaginous tissue spatially and functionally replaces nucleus pulposus2022

    • Author(s)
      Kamatani Takashi、Hagizawa Hiroki、Yarimitsu Seido、Morioka Miho、Koyamatsu Saeko、Sugimoto Michihiko、Kodama Joe、Yamane Junko、Ishiguro Hiroyuki、Shichino Shigeyuki、Abe Kuniya、Fujibuchi Wataru、Fujie Hiromichi、Kaito Takashi、Tsumaki Noriyuki
    • Journal Title

      Biomaterials

      Volume: 284 Pages: 121491-121491

    • DOI

      10.1016/j.biomaterials.2022.121491

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] メタノール固定細胞を用いたマルチプレックスscRNA-seqのためのUSB細胞標識法2023

    • Author(s)
      杉本道彦、田夛祐喜、趙 杜善、阿部訓也
    • Organizer
      日本遺伝学会第95回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内小胞輸送に関わるVps52の発生制御因子としての機能解明を目指して2023

    • Author(s)
      杉本道彦
    • Organizer
      第33回モロシヌス研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] マルチプレックスscRNA-seq解析のためのUSB細胞標識法~メタノール固定サンプルへの使用例~2023

    • Author(s)
      杉本道彦、田夛祐喜、趙 杜善、阿部訓也
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Barcoding of MeOH-fixed cells by the USB method for sample multiplexing of scRNA-seq analysis2023

    • Author(s)
      Michihiko Sugimoto, Dooseon Cho, Yuhki Tada, Kuniya Abe
    • Organizer
      36th International Mammalian Genome Conference
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Universal Surface biotinylation (USB): A simple, versatile and cost-effective sample multiplexing method for single-cell RNA-seq analysis2022

    • Author(s)
      Michihiko Sugimoto, Yuhki Tada, Kuniya Abe
    • Organizer
      35th International Mammalian Genome Conference
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] scRNA-seqにおけるサンプルマルチプレックス化のための新規細胞標識法2022

    • Author(s)
      杉本道彦、田夛祐喜、七野成之、小屋松冴子、妻木範行、阿部訓也
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細胞の標識方法2023

    • Inventor(s)
      杉本道彦、阿部訓也
    • Industrial Property Rights Holder
      理化学研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細胞の標識法2022

    • Inventor(s)
      杉本道彦、阿部訓也
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人理化学研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi