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Analysis of H2A.Z forming transcriptionally active chromatin structures

Research Project

Project/Area Number 20K06496
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionJapanese Foundation for Cancer Research

Principal Investigator

Tachiwana Hiroaki  公益財団法人がん研究会, がん研究所 がん生物部, 研究員 (70546382)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsヒストンバリアントt / クロマチン / エピジェネティクス / ヒストンバリアント / H2A.Z / ヒストン
Outline of Research at the Start

本研究はエピジェネティクス研究の重要な課題であるクロマチン構造による転写制御機構の解析を行う。特にクロマチンの基本単位であるヌクレオソームを形成しているヒストンの亜種であるH2A.Z に着目する。H2A.Z はアクティブな転写開始点近傍のクロマチンに集積し、その領域に特異的なクロマチン構造の形成および維持に機能していることが知られているが、そのメカニズムは明らかになっていない。そこで本研究では、H2A.Z の機能解析を通してクロマチン構造による転写制御機構の解明を行う。本研究は、遺伝子発現プロファイルが変化する発生、分化もしくは細胞のがん化などの理解につながることが期待される。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we found a correlation between chromatin structure and histone incorporation. In the case of transcriptionally repressed, highly condensed chromatin, histone incorporation occurs only by a mechanism coupled to DNA replication. While in the case of transcriptionally active, less condensed chromatin, histone incorporation occurs in a DNA replication-independent manner. This indicates that the localization of each histone variant on genomic DNA is regulated by chromatin structure.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究成果はエピジェネティクス研究の重要な課題であるクロマチン構造による転写制御機構の解明をおこなった。本研究により、クロマチン構造による転写制御機構が明らかになり、遺伝子発現プロファイルが変化する生命現象(発生、分化、細胞のがん化、外部刺激への応答など)の理解につながることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (5 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Chromatin structure-dependent histone incorporation revealed by a genome-wide deposition assay2021

    • Author(s)
      Hiroaki Tachiwana, Mariko Dacher, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yosuke Seto, Ryohei Katayama, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka, Noriko Saitoh
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10

    • DOI

      10.7554/elife.66290

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Nuclear Long Non-Coding RNAs as Epigenetic Regulators in Cancer2021

    • Author(s)
      Tachiwana Hiroaki、Saitoh Noriko
    • Journal Title

      Current Medicinal Chemistry

      Volume: 28 Issue: 25 Pages: 5098-5109

    • DOI

      10.2174/0929867328666210215114506

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chromatin structure-dependent histone incorporation revealed by a genome-wide deposition assay2021

    • Author(s)
      Tachiwana H, Dacher M, Maehara K, Harada A, Seto Y, Katayama R, Ohkawa Y, Kimura H, Kurumizaka H, Saitoh N.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: in press

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Nucleosome destabilization by nuclear non-coding RNAs.2020

    • Author(s)
      †Fujita R, †Yamamoto T, Arimura Y, Fujiwara S, Tachiwana H, Ichikawa Y, Sakata S, Yang L, Maruyama R, Hamada M, Nakao M, *Saitoh N, *Kurumizaka H
    • Journal Title

      Commun Biol

      Volume: 3 Issue: 1 Pages: 60-60

    • DOI

      10.1038/s42003-020-0784-9

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] HDAC inhibitors induce H2A.Z accumulations to gene bodies in specific genes and their transcription suppression2022

    • Author(s)
      立和名博昭 , 斉藤典子
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 長鎖イントロンを持つ遺伝子の転写制御機構の解析2022

    • Author(s)
      立和名博昭 , 斉藤典子
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ヒストンH2A.Z による転写活性化クロマチン認識機構の解析2021

    • Author(s)
      立和名 博昭、大川恭行、胡桃坂仁志、斉藤典子
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Analysis of chromatin dynamics using permeabilized cells and reconstituted histone H2A.Z-H2B complex2021

    • Author(s)
      Tachiwana Hiroaki, Kurumizaka Hitoshi, Saitoh Noriko
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 転写制御に機能するヒストンH2A.Z のクロマチン局在機構の解析2020

    • Author(s)
      立和名博昭、ダッシェマリコ、前原一満、原田哲仁、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志、斉藤典子
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Book] セントラルドグマの新常識:転写・翻訳の驚きの新機構と再定義されるDNA・RNA・タンパク質の世界:(第2章)転写の新常識 lncRNA・eRNAによる転写制御.2022

    • Author(s)
      斉藤典子, 立和名博昭, 松戸亮太
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      羊土社
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Book] がんゲノム医療時代の分子腫瘍学:(第1部)がんの分子病理学(序論):がんの分子生物学:エピジェネティクス:RNAによる制御.2022

    • Author(s)
      立和名博昭, 斉藤典子
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      文光堂
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Book] 病理と臨床 臨時増刊号 がんゲノム医医療時代の分子腫瘍学2021

    • Author(s)
      立和名博昭、斉藤典子
    • Total Pages
      412
    • Publisher
      文光社
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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