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Studies on molecular mechanism of heme-dependent retrograde signaling in plant cells

Research Project

Project/Area Number 20K06681
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Masuda Tatsuru  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (00242305)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords葉緑体 / ヘム / レトログレードシグナル / テトラピロール / ABCトランスポーター / 情報伝達 / トランスポーター / 色素体 / シグナル伝達 / レトログレード
Outline of Research at the Start

植物における機能的な葉緑体構築は、核からのアンテログレードシグナルと、プラスチドからのレトログレードシグナル(RS)のバランスにより制御されている。RSの分子機構は未だ明らかではなく、その解明には感知、伝達、応答の機構を明らかにすることが重要である。本研究では、植物細胞におけるヘムに依存したRSの分子機構の全貌解明に取り組むことを目的とする。

Outline of Final Research Achievements

We elucidate the molecular mechanisms of heme-dependent retrograde signaling in plant cells. Functional chloroplast development in plants is regulated by the communication between anterograde signals from the nucleus and retrograde signals (RS) from the plastids. With regard to the RSs involved in chloroplast biogenesis, we have shown for the first time that the pigment-localized GUN1 protein plays a central role as a sensor of chloroplast differentiation and regulates the transduction of heme, through the regulation of heme synthase FC1.
Here, we proposed a model in which GUN1 accumulated in the plastid forms heme-binding droplets and transports heme during chloroplast differentiation. We also identified and studied the function of the ABC transporter that can specifically transport heme.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまで植物細胞における、ヘム輸送機構に関しては全く明らかになっていなかった。我々は植物細胞から初めてヘム特異的ABCトランスポーターを同定した。これまで色素体で合成されたヘムが、細胞質を経て輸送されるのか、あるいは膜接触部位を通じて小胞体やミトコンドリアに輸送されるのかは明らかではなかった。しかし、細胞質局在型HO1の発現により、のgun表現型が消失したことから、色素体から細胞質へのヘム輸送がRS伝達において重要であることを初めて明らかにした。以上のことから、本研究により植物細胞におけるヘム依存RSの分子機構に新たな知見を与える、学術的に重要な意義を持つ成果が得られたと考えられる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (29 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (19 results) Book (2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Polysulfide metabolizing enzymes influence SqrR-mediated sulfide-induced transcription by impacting intracellular polysulfide dynamics2023

    • Author(s)
      Shimizu Takayuki、Ida Tomoaki、Antelo Giuliano T、Ihara Yuta、Fakhoury Joseph N、Masuda Shinji、Giedroc David P、Akaike Takaaki、Capdevila Daiana A、Masuda Tatsuru
    • Journal Title

      PNAS Nexus

      Volume: 2 Issue: 3 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgad048

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Thioredoxin-2 Regulates SqrR-Mediated Polysulfide-Responsive Transcription via Reduction of a Polysulfide Link in SqrR2023

    • Author(s)
      Shimizu Takayuki、Hashimoto Masaru、Masuda Tatsuru
    • Journal Title

      Antioxidants

      Volume: 12 Issue: 3 Pages: 699-699

    • DOI

      10.3390/antiox12030699

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Persulfide-Responsive Transcription Factor SqrR Regulates Gene Transfer and Biofilm Formation via the Metabolic Modulation of Cyclic di-GMP in Rhodobacter capsulatus2022

    • Author(s)
      Shimizu Takayuki、Aritoshi Toma、Beatty J. Thomas、Masuda Tatsuru
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 10 Issue: 5 Pages: 908-908

    • DOI

      10.3390/microorganisms10050908

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] テトラピロールおよびGUN1プラスチドシグナルを介した葉緑体形成2021

    • Author(s)
      清水隆之、増田建
    • Journal Title

      光合成研究

      Volume: 31 Pages: 50-62

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Repressor Activity of SqrR, a Master Regulator of Persulfide-Responsive Genes, Is Regulated by Heme Coordination2021

    • Author(s)
      Shimizu T, Hayashi Y, Arai M, McGlynn SE, Masuda T, Masuda S
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: 62 Issue: 1 Pages: 100-110

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa144

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The Role of Tetrapyrrole- and GUN1-Dependent Signaling on Chloroplast Biogenesis2021

    • Author(s)
      Shimizu T, MasudaT
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 10 Issue: 2 Pages: 196-196

    • DOI

      10.3390/plants10020196

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 硫化水素依存的光合成の転写制御に関わるポリスルフィド代謝の解析2023

    • Author(s)
      清水隆之、井田智章、Giuliano T. Antelo、井原雄太、増田真二、David P. Giedroc、赤池孝章、Daiana A. Capdevila、増田建
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Enhancement of accumulation of photosynthetic pigments and proteins during chloroplast biogenesis by sulfide in Arabidopsis thaliana2023

    • Author(s)
      Zurina Osuman, Takayuki Shimizu, Tatsuru Masuda
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      第64回日本植物生理学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Light mediates transcription start sites of heme oxygenase 1 for a cytoplasmic heme decomposition bypass in Arabidopsis2023

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      Yingxi Chen, Kohji Nishimura, Yoshiharu Yamamoto, Yoshito Oka, Tomonao Matsushita, Takayuki Shimizu, Tatsuru Masuda
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      第64回日本植物生理学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物の器官発生におけるシトクロムb5様ヘム結合タンパク質RLFの機能解析2023

    • Author(s)
      岩田健太郎、後藤千恵子、福村日向丸、清水隆之、丸山海成、古谷朋之、近藤侑貴、笠原博幸、増田建、石崎公庸、深城英弘
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 地上部ヘムシグナルはpre-mRNAスプライシング制御を介して側根形態を制御する2023

    • Author(s)
      高柳なつ、荒江星拓、高橋洋和、清水隆之、堀口吾朗、相田光宏、深城英弘、増田建、大谷美沙都
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナABCトランスポーターABCG23の機能解析2022

    • Author(s)
      増田建、宮地孝明、西村浩二、清水隆之
    • Organizer
      第86回日本植物学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Effect of Sulfide on phytochrome-dependent photomorphogenesis in Arabidopsis thaliana2022

    • Author(s)
      Zurina Osuman, Takayuki Shimizu, Tatsuru Masuda
    • Organizer
      第86回日本植物学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Phytochromes mediated transcription start sites of heme oxygenase 1 in Arabidopsis thaliana2022

    • Author(s)
      Yingxi Chen, Kohji Nishimura, Yoshiharu Yamamoto, Takayuki Shimizu, Tatsuru Masuda
    • Organizer
      第86回日本植物学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ヘムシグナルによる側根形成制御にはpre-mRNAスプライシング制御が介在する2022

    • Author(s)
      高柳なつ、荒江星拓、高橋洋和、清水隆之、堀口吾朗、相田光宏、深城英弘、増田建、大谷美沙都
    • Organizer
      第86回日本植物学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 紅色光合成細菌における硫化水素応答性転写因子SqrRによるファージ様粒子GTAを介した遺伝子伝播の制御機構2022

    • Author(s)
      清水隆之、有年統真、J. Thomas Batty、増田建
    • Organizer
      第12回日本光合成学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 紅色光合成細菌におけるファージ様粒子GTAを介した遺伝子水平伝播の酸化ストレス応答性制御機構2022

    • Author(s)
      有年統真、清水隆之、増田建
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Light regulated transcription start sites of Heme oxygenase 1 in Arabidopsis thaliana2022

    • Author(s)
      Yingxi Chen, Kohji Nishimura, Yoshiharu Y Yamamoto, Takayuki Shimizu, Tatsuru Masuda
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] プラスチドシグナル依存的な側根形成制御におけるpre-mRNAスプライシングの役割2021

    • Author(s)
      高柳なつ、荒江星拓、高橋洋和、清水隆之、堀口吾郎、相田光宏、深城英弘、増田建、大谷美沙都
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Light- and tissue-dependent regulation of transcriptional start sties of HO1 in Arabidopsis thaliana2021

    • Author(s)
      Yingxi Chen, Kohji Nishimura, Yoshiharu Y Yamamoto, Takayuki Shimizu, Tatsuru Masuda
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 硫化水素による生理活性調節シグナル伝達機構の解明2021

    • Author(s)
      清水隆之、増田真二、増田建
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Plastid stress is reflected in lateral root morphogenesis via pre-mRNA splicing regulation in plants2021

    • Author(s)
      高柳なつ、荒江星拓、高橋洋和、清水隆之、堀口吾郎、相田光宏、深城英弘、増田建、大谷美沙都
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Biochemical characterization of Arabidopsis ABC transporter that can bind to hemin2021

    • Author(s)
      Zijing L, Nishimura K, Shimizu T, Masuda T
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Interaction of porphyrins with the loop region of Arabidopsis ABC transporter2021

    • Author(s)
      Zijing L, Shimizu T, Masuda T
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 硫化水素依存的な生理活性調節におけるパースルフィド応答機構の分子基盤2021

    • Author(s)
      清水隆之、増田真二、増田建
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
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      2020 Research-status Report
  • [Book] 植物のヘム合成と代謝 in ヘムタンパク質の科学2022

    • Author(s)
      増田 建
    • Total Pages
      12
    • Publisher
      NTS
    • ISBN
      9784860437787
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Book] 光合成2021

    • Author(s)
      日本光合成学会編
    • Total Pages
      213
    • Publisher
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254171761
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      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 増田研究室ホームページ

    • URL

      http://webpark1435.sakura.ne.jp/wp/

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      2022 Annual Research Report
  • [Remarks] 増田・清水研究室ホームページ

    • URL

      http://webpark1435.sakura.ne.jp/wp/

    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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