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Coordinate epigenetic gene regulation by AS2 and nucleolar factors in leaf formation

Research Project

Project/Area Number 20K06702
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

Machida Yasunori  名古屋大学, 理学研究科, 名誉教授 (80175596)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 笹部 美知子  弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (00454380)
町田 千代子  中部大学, 応用生物学部, 特定教授 (70314060)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
KeywordsAS2 遺伝子 / 葉の形態形成 / 葉の表裏 / 核小体 / 核小体顆粒 / 核小体ストレス / ribosomal DNA / エピジェネティック制御 / ASYMMETRIC LEAVES 2 遺伝子 / 葉の形態発生 / AS2 ボディー / リボソーム RNA 遺伝子 / betaC1 遺伝子 / 葉形成 / 表と裏 / アシンメトリー遺伝子
Outline of Research at the Start

葉の形成に於いて、ARF3遺伝子は裏側化遺伝子として機能する。葉の表側の分化の為には、予定表側領域において ARF3 遺伝子発現は抑制される必要がある。AS2はこの抑制のための中心的な遺伝子である。AS2 は核小体周縁部で AS2 bodyという核内顆粒を形成する。AS2 bodyは、クロモセンター(リボソームRNA遺伝子のリピートが凝縮し高度にヘテロクロマチン化している核内構造体)と共局在する。本研究では、AS2 bodyと核小体因子との協調的な作用という視点から、ARF3 遺伝子発現のエピジェネティックな抑制の仕組みを解明する。

Outline of Final Research Achievements

The leaves of many dicotyledonous plants are flat, photosynthetic organs that develop from stem cells at the tip of the stem. The Arabidopsis ASYMMETRIC-LEAVES2 (AS2) gene is involved in the balanced formation of cell populations on the adaxial (upper) and abaxial (bottom) sides of leaves during the early stages of leaf primordium formation. AS2 protein forms AS2 bodies (granules) with characteristic morphology and distribution within the nucleolus, which are essential for AS2 function. The nucleolus is the site of ribosome formation, and abnormalities in factors related to this cause nucleolar stress. The nucleolus is the site of ribosome formation, and abnormalities in factors related to events called the nucleolar stress. Loss-of-function as2 mutations exaggerate the extent of the nucleolar stress, suggesting that the wild-type AS2 gene plays a role in protecting plants from such a stress.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

AS2は、我々が、2002年に世界で初めてシロイヌナズナにおいて報告した遺伝子である。今回、我々は、AS2は、核小体ストレスを防御する因子であるという作業仮説を立てた。このようなタンパク質は、植物では初めてである。動物と酵母には、構造的にAS2と類似しているタンパク質はない。従って今回の成果は新奇性が高いといえる。動物では、p53異常が関わる核小体ストレスは細胞の癌化と関連しているが、植物では、p53と構造的に近いタンパク質は同定されていない。AS2はp53と機能的類似性を示すが、分子的関連性は不明である。またAS2が、植物ウイルスの病徴タンパク質βC1の機能と関連していることは興味深い。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (40 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (32 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] Arabidopsis ASYMMETRIC LEAVES2 and Nucleolar Factors Are Coordinately Involved in the Perinucleolar Patterning of AS2 Bodies and Leaf Development2023

    • Author(s)
      Ando Sayuri、Nomoto Mika、Iwakawa Hidekazu、Vial-Pradel Simon、Luo Lilan、Sasabe Michiko、Ohbayashi Iwai、Yamamoto Kotaro T.、Tada Yasuomi、Sugiyama Munetaka、Machida Yasunori、Kojima Shoko、Machida Chiyoko
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 12 Issue: 20 Pages: 3621-3621

    • DOI

      10.3390/plants12203621

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    • Author(s)
      Machida Yasunori、Suzuki Takanori、Sasabe Michiko、Iwakawa Hidekazu、Kojima Shoko、Machida Chiyoko
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 135 Issue: 1 Pages: 3-14

    • DOI

      10.1007/s10265-021-01349-6

    • NAID

      40022803527

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  • [Journal Article] Actin Filament Disruption Alters Phragmoplast Microtubule Dynamics during the Initial Phase of Plant Cytokinesis2020

    • Author(s)
      Maeda Keisho、Sasabe Michiko、Hanamata Shigeru、Machida Yasunori、Hasezawa Seiichiro、Higaki Takumi
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 61 Issue: 3 Pages: 445-456

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa003

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    • Author(s)
      Iwakawa Hidekazu、Takahashi Hiro、Machida Yasunori、Machida Chiyoko
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 21 Issue: 19 Pages: 7314-7314

    • DOI

      10.3390/ijms21197314

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  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生・分化に関わるAS2と核小体タンパク質は特定の遺伝子のDNAメチル化維持に関与する2023

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      小島晶子 岩川秀和 日比野哲紀 高橋広夫 安藤沙友里 笹部美智子 伊藤正樹 町田泰則 町田千代子
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      笹部美知子、三上裕大、冨田昌伸、山地良樹、濱田隆宏、中神弘史、橋本隆、町田泰則
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      鈴木崇紀、岩川秀和、安藤沙友里、小島晶子、町田千代子、笹部美知子、栗原大輔、東山哲也、町田泰則
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  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生分化に関わるAS2と核小体タンパク質によるDNAメチル化維持機能の解明2023

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      小島晶子、岩川秀和、日比野哲紀、高橋広夫、安藤沙友里、笹部美知子、伊藤正樹、町田泰則、町田千代子
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      安藤沙友里、野元美佳、岩川秀和、Vial-Pradel Simon、多田安臣、山本興太朗、町田泰則、小島晶子、町田千代子
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  • [Presentation] AS2 bodyが関わる葉の発生分化における核小体の新しい機能2022

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      町田千代子、安藤沙友里、岩川秀和、栗原大輔、東山哲也、笹部美知子、町田泰則、小島晶子
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  • [Presentation] 葉の形成に関わるAS2遺伝子およびAS2/LOBファミリーの起源をゲノムデータベースから探る2022

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      岩川秀和、安藤沙友里、小島晶子、笹部美知子、伊藤正樹、町田泰則、町田千代子
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      安藤沙友里、野元美佳、岩川秀和、Simon Vial-Pradel、多田安臣、山本興太朗、町田泰則、小島晶子、町田千代子
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  • [Presentation] ゲノムデータベースからシロイヌナズナASYMMETRIC LEAVES2 (AS2) の期限を探る2022

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      岩川秀和、小島晶子、笹部美知子、松本省吾、町田泰則、町田千代子
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  • [Presentation] シロイヌナズナのAS2のzinc-finger motifの分子機能の解析2021

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      Sayuri Ando, Hidekazu Iwakawa, Shoko Kojima, Yasunori Machida, Chiyoko Machida
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  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生分化におけるエピジェネティック因子AS2と核小体タンパク質の役割の解明2021

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      町田千代子、高橋広夫、日比野哲紀、安藤沙友里、岩川秀和、野元美佳、多田正臣、杉山宗隆、小島晶子、町田泰則
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  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の向背軸性確立におけるAS2 bodyと核小体の役割2020

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      安藤沙友里、岩川秀和、高橋広夫、栗原大輔、東山哲也、笹部美知子、町田泰則、町田千代子、小島晶子
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      安藤沙友里、岩川秀和、小島晶子、杉山宗隆、町田泰則、町田千代子
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      岩川秀和、坂本卓也、坂本勇貴、野元美佳、松永幸大、多田安臣、町田泰則、町田千代子
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  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生・分化におけるzinc-finger protein AS2によるエピジェネティック制御2020

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      日比野哲紀、高橋広夫、鈴木雅貴、Pradel S Vial、町田泰則、小島晶子、町田千代子
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      日本植物学会第84回大会
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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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