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How does an anamorphic yeast acquire species diversity?

Research Project

Project/Area Number 20K06801
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
Research InstitutionTokyo University of Agriculture

Principal Investigator

Takashima Masako  東京農業大学, その他部局等, 特命教授 (20333304)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
KeywordsCutaneotrichosporon / species / taxonomy / C. cavernicola / ハイブリッドゲノム / Trichosporonales目 / 酵母 / 種内多様性 / ドラフトゲノム / 酵母分類 / 微生物多様性 / ゲノム / 生活環 / 種
Outline of Research at the Start

酵母の既知種の半数以上は有性生活環が知られていない“無性時代”である。しかし“無性時代”酵母が単にクローンとして細胞分裂を繰り返し、突然変異の蓄積だけで種内や種間の多様性を獲得してきたとは考えにくく、これら以外にも生物学的多様性を獲得して環境への適応を可能にする仕組みがあるのではないかと推定できる。本研究では、この仕組みを菌学的および分子生物学的手法の両方を用いて解明する。

Outline of Final Research Achievements

Trichosporonales (subphylum: Agaricomycotina; phylum: Basidiomycota) is a taxon which includes causative agents of both deep-seated and superficial mycoses, as well as strains that have high potential as oleaginous yeasts, indicating the high metabolic and functional activity of this taxon. As teleomorphs have not yet been reported in this group, this study was conducted to clarify the reason behind this high activity. Chromosome-level genomic information from Cutaneotrichosporon cavernicola strains indicate that one strain has a heterozygous genome, and the other strains presumably include the parental genomes of the heterozygous genome strain. We suggest that this group of strains is a suitable model for future studies of intraspecific or interspecific hybridization and for speciation research .

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

出芽や分裂によって増殖する酵母は、系統学的には子嚢菌門および担子菌門の両方に存在する極めて多様な菌群である。一方、酵母の既知種の半数以上は有性生活環が知られていない“無性時代”である。それでは“無性時代”酵母は単にクローンとして細胞分裂を繰り返し、突然変異の蓄積だけで、これほど広範な多様性を獲得してきたのだろうか? 本研究により、この問いに対する研究遂行に資するための酵母菌株と染色体レベルのゲノム情報の両方が整ったデータセットが得られた。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Chromosome-level genome assemblies of Cutaneotrichosporon spp. (Trichosporonales, Basidiomycota) reveal imbalanced evolution between nucleotide sequences and chromosome synteny2023

    • Author(s)
      Kobayashi Yuuki、Kayamori Ayane、Aoki Keita、Shiwa Yuh、Matsutani Minenosuke、Fujita Nobuyuki、Sugita Takashi、Iwasaki Wataru、Tanaka Naoto、Takashima Masako
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 24 Issue: 1 Pages: 609-609

    • DOI

      10.1186/s12864-023-09718-2

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Intrageneric genomic relationship and evolution of non-model Basidiomycota yeasts based on chromosome-level genome assemblies.2023

    • Author(s)
      Yuuki Kobayashi, Ayane Kayamori, Keita Aoki, Yuh Shiwa, Minenosuke Matsutani, Nobuyuki Fujita, Takashi Sugita, Wataru Iwasaki, Moriya Ohkuma, Naoto Tanaka, Masako Takashima.
    • Organizer
      37th International Specialized Symposium on Yeasts (ISSY37)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 担子菌酵母Cutaneotrichosporon属ゲノムにみる塩基配列と染色体構造の変異速度.2023

    • Author(s)
      小林裕樹,栢森綺音,青木敬太,志波優,藤田信之,杉田隆,岩崎渉,田中尚人,高島昌子.
    • Organizer
      日本菌学会第67回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 全ゲノム情報に基づいた担子菌酵母の変異と種分化の解析.2023

    • Author(s)
      小林裕樹,栢森綺音,青木敬太,志波優,松谷峰之介,藤田信之,杉田隆,岩崎渉,大熊盛也,田中尚人,高島昌子
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] ゲノム情報に基づいた担子菌酵母Cutaneotrichosporon cavernicolaの種分化の解析2023

    • Author(s)
      小林裕樹、栢森綺音、青木敬太、志波優、藤田信之、杉田隆、田中尚人、高島昌子
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 比較ゲノムによる Cutaneotrichosporon cavernicola の交配型遺伝子座の解析2022

    • Author(s)
      栢森綺音、青木敬太、志波優、藤田信之、杉田隆、高島昌子、田中尚人
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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