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Fully automatic analysis of glycans and phosphorylation using a highly functional microchip electrophoresis system

Research Project

Project/Area Number 20K06993
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
Research InstitutionKindai University

Principal Investigator

Yamamoto Sachio  近畿大学, 薬学部, 准教授 (10707954)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords糖鎖 / リン酸化 / マイクロチップ電気泳動 / リン酸化ペプチド / Phos-tag / アクリルアミドゲル / リン酸化タンパク質
Outline of Research at the Start

ガンなどの疾病により発現する糖鎖やタンパク質のリン酸化状態が変化したという知見が数多く報告されているが,それぞれの翻訳後修飾がどのタイミングでどのように変化した結果,糖鎖構造やリン酸化状態が変化したという報告はない。これを解明するために前処理を含む一連の分析操作が特に困難な糖鎖や細胞のシグナル伝達に必要不可欠なリン酸化反応を明らかにするために,アクリルアミドゲル層と3次元型のマイクロチップを用いて糖鎖やリン酸化化合物の分析までに必要な前処理を含む一連の工程を流路中で行うことにより真のハイスループット分析を実現する。

Outline of Final Research Achievements

In this research, we used an acrylamide gel layer and a three-dimensional microchip to perform a series of steps such as pretreatment necessary for analyzing sugar chains and phosphorylated compounds in a flow channel, achieving true high-throughput analysis.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

糖鎖修飾やタンパク質のリン酸化などの翻訳後修飾を解明しようとする研究が世界中で盛んに行われているが,それぞれの翻訳後修飾がどのタイミングでどのように変化した結果,糖鎖構造やリン酸化状態が変化したという報告はない。そこで、何らかの刺激を与えた直後のタンパク質の翻訳後修飾のメカニズムを解明するために,糖鎖およびリン酸化タンパク質の分析までに必要な前処理を含む一連の工程を流路中で,かつプログラムされた電圧印加のみで行うことにより真のハイスループット分析を実現する方法を実現した。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (32 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 7 results) Presentation (19 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] A rapid and convenient enzyme digestion method for the analysis of N-glycans using exoglycosidase-impregnated polyacrylamide gels fabricated in an automatic pipette tip2023

    • Author(s)
      Yamamoto Sachio、Kato Naho、Wada Miki、Kinoshita Mitsuhiro
    • Journal Title

      Analytical Sciences

      Volume: 39 Issue: 7 Pages: 1041-1046

    • DOI

      10.1007/s44211-023-00314-8

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microchip electrophoresis utilizing an in situ photopolymerized Phos-tag acrylamide gel for specific entrapment and highly sensitive analysis of phosphorylated compounds2023

    • Author(s)
      Yamamoto Sachio、Yano Shoko、Suzuki Shigeo、Kinoshita Mitsuhiro
    • Journal Title

      Electrophoresis Letters

      Volume: 67 Issue: 1 Pages: 33-36

    • DOI

      10.2198/electroph.67.33

    • ISSN
      2189-2628, 2189-2636
    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Study of HPLC Separation and Fractionation of 8-aminopyrene-1,3,6-trisulfonic Acid Labeled <i>N</i>-glycans Using a Hydrophilic Interaction Chromatography Column2022

    • Author(s)
      YAMAMOTO Sachio、MIYAWAKI Naohisa、KAWAKAMI Natsumi、KINOSITA Mitsuhiro、SUZUKI Shigeo
    • Journal Title

      BUNSEKI KAGAKU

      Volume: 71 Issue: 6 Pages: 333-339

    • DOI

      10.2116/bunsekikagaku.71.333

    • ISSN
      0525-1931
    • Year and Date
      2022-06-05
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  • [Journal Article] Chromatographic Performance of an Amine/amino-bonded Column and a Monolithic Reversed-Phase Column for the Separation of Fluorescently Labeled Glycoprotein Glycans2021

    • Author(s)
      HIOKI Maho、KOBAYASHI Hiroshi、KINOSHITA Mitsuhiro、YAMAMOTO Sachio、SUZUKI Shigeo
    • Journal Title

      CHROMATOGRAPHY

      Volume: 42 Issue: 2 Pages: 99-107

    • DOI

      10.15583/jpchrom.2021.005

    • NAID

      130008061750

    • ISSN
      1342-8284, 1348-3315
    • Year and Date
      2021-06-20
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    • Author(s)
      YAMAMOTO Sachio、KAWAGUCHI Yume、KINOSHITA Mitsuhiro、SUZUKI Shigeo
    • Journal Title

      CHROMATOGRAPHY

      Volume: 42 Issue: 1 Pages: 37-42

    • DOI

      10.15583/jpchrom.2020.018

    • NAID

      130007993874

    • ISSN
      1342-8284, 1348-3315
    • Year and Date
      2021-02-20
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    • Author(s)
      YAMAMOTO Sachio
    • Journal Title

      CHROMATOGRAPHY

      Volume: 42 Issue: 1 Pages: 29-36

    • DOI

      10.15583/jpchrom.2020.020

    • NAID

      130007993888

    • ISSN
      1342-8284, 1348-3315
    • Year and Date
      2021-02-20
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      Yamamoto Sachio、Yano Shoko、Kinoshita Mitsuhiro、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      Gels

      Volume: 7 Issue: 4 Pages: 268-268

    • DOI

      10.3390/gels7040268

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    • Author(s)
      Kinoshita Mitsuhiro、Nakajima Kazuki、Yamamoto Sachio、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      Analytical and Bioanalytical Chemistry

      Volume: 413 Issue: 19 Pages: 4727-4738

    • DOI

      10.1007/s00216-021-03434-0

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      Kinoshita Mitsuhiro、Nakatani Yumi、Yamada Keita、Yamamoto Sachio、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis

      Volume: 195 Pages: 113875-113875

    • DOI

      10.1016/j.jpba.2020.113875

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      Yamamoto Sachio、Ueda Maki、Kasai Masataka、Ueda Yusuke、Kinoshita Mitsuhiro、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis

      Volume: 179 Pages: 112995-112995

    • DOI

      10.1016/j.jpba.2019.112995

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    • Author(s)
      Kinoshita Mitsuhiro、Saito Ai、Yamamoto Sachio、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis

      Volume: 186 Pages: 113267-113267

    • DOI

      10.1016/j.jpba.2020.113267

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    • Author(s)
      Kinoshita Mitsuhiro、Yamamoto Sachio、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 5 Issue: 30 Pages: 18608-18618

    • DOI

      10.1021/acsomega.0c00935

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    • Author(s)
      Kishimoto Yuka、Okada Fuka、Maesako Tomohiro、Yamamoto Sachio、Kinoshita Mitsuhiro、Hayakawa Takao、Suzuki Shigeo
    • Journal Title

      Journal of Chromatography A

      Volume: 1625 Pages: 461194-461194

    • DOI

      10.1016/j.chroma.2020.461194

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      日本薬学会第141年会
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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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