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Molecular mechanism of the p53-mediated intra-nuclear dynamics of H3K27me3

Research Project

Project/Area Number 20K07305
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Oikawa Tsukasa  北海道大学, 医学研究院, 講師 (20457055)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
KeywordsH3.1 / p53 / H3K27me3 / ヒストンH3.1 / 核膜脂質 / ヒストンH3 / EZH2 / 上皮-間葉転換 / replication
Outline of Research at the Start

研究代表者らは、p53が上皮性を保障する新しい機構を明らかにした(Oikawa et al., Sci Rep, 2018)。その後の研究から以下のことが示唆された。(1)p53は複製期のヒストンH3インタラクトームからEZH2を排除するが、これは核膜近傍における局所的なイベントである。(2)この過程の破綻は、E-cadherin(CDH1)遺伝子を含む限られた遺伝子領域のH3K27me3増加に至る。本研究は、これらの新しい知見に焦点を当て、その分子的基盤とともに、上皮性維持と破綻への関与を明らかにするものである。

Outline of Final Research Achievements

H3.1 is a DNA replication-dependent histone, predominantly synthesized and enters into the nucleus during S phase of the cell cycle. Although molecular chaperones that guide H3.1 to sites of the DNA replication are identified, processes related to the H3.1 nuclear entry remain largely unknown. We showed that p53 is involved therein. C-terminal domain nuclear envelope phosphatase 1 (CTDNEP1) was found within the H3.1 interactome. CTDNEP1 is known to convert phosphatidic acid (PA) to diacylglycerol (DAG) via lipin PA phosphatases, and we found that H3.1 exhibits a significantly higher affinity to PA than to DAG. Loss of p53 increased nuclear PA levels, in which CTDNEP1 levels were downregulated. Intriguingly, H3.1 molecules, not yet interacting with DNA, were accumulated in the vicinity of the nuclear envelope (NE) and K27-trimethylated perhaps by EZH2. These events were predominantly observed during the S phase.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

p53は上皮細胞の分化形質の維持において重要な働きをする。その機構として、p53が発現誘導するmicro RNAsを介し、上皮間葉転換に関連した遺伝子発現変化を引き起こす転写因子(ZEB1, SNAI1など)の発現が抑制されることが重要であるとされてきた。しかし、p53喪失は上皮性を失わせる場合がある一方、そうでない場合もある。さらに、線維芽細胞などの間葉系細胞においてもp53は発現しているが、ZEB1等が常に発現し、上皮性は認められない。従って、細胞の分化形質維持におけるp53機能について我々の理解は十分とは言えず、本研究による成果はこの点で我々の理解を拡大するものである。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2022 2021 2020 Other

All Presentation (6 results) Remarks (2 results)

  • [Presentation] p53 は核脂質を調節しヒストンH3.1の核内侵入に影響を与える2022

    • Author(s)
      Tsukasa Oikawa, Junya Hasegawa, Naomi Ohnishi, Yasuhito Onodera, Ari Hashimoto, Junko Sasaki, Takehiko Sasaki, Koji Ueda and Hisataka Sabe
    • Organizer
      第74回日本細胞生物学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] p53 modulates nuclear lipid composition and affects the nuclear entry of histone H3.12022

    • Author(s)
      Tsukasa Oikawa, Junya Hasegawa, Naomi Ohnishi, Yasuhito Onodera, Ari Hashimoto, Junko Sasaki, Takehiko Sasaki, Koji Ueda and Hisataka Sabe
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] p53によるヒストンメチル化制御機構の解析2021

    • Author(s)
      及川 司
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 細胞核内ヒストンメチル化ダイナミクスの理解に向けた数理解析2021

    • Author(s)
      及川 司
    • Organizer
      第31回日本数理生物学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] p53によるヒストンメチル化調節機構の解析2021

    • Author(s)
      及川 司
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] p53 counteracts EZH2 at the nuclear lamina to prevent H3K27 hypermethylation2020

    • Author(s)
      Tsukasa Oikawa, Naomi Ohnishi, Yasuhito Onodera, Ari Hashimoto, Koji Ueda, and Hisataka Sabe
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] 北海道大学大学院医学研究院分子生物学教室

    • URL

      https://molbiolhokudai.wixsite.com/website

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Remarks] research map

    • URL

      https://researchmap.jp/read0135625

    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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