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Zfat-regulated non-coding RNA transcription at the centromeres and relationship to cancer.

Research Project

Project/Area Number 20K07317
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
Research InstitutionFukuoka University

Principal Investigator

Ishikura Shuhei  福岡大学, 医学部, 准教授 (40336631)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsセントロメア / ノンコーディングRNA / ヒストンアセチル化 / ZFAT / CENP-B / DAXX / BRD4 / KAT2B / ncRNA / エピゲノム / KAT2B・PCAF / KAT2B/PCAF / Zfat / ガン
Outline of Research at the Start

細胞分裂において複製した染色体を正確、かつ均等に娘細胞に分配することは、個体の発生や生命の継承にとって必須である。セントロメアは、均等な染色体分配に必須の染色体領域であり、その異常が、がんの発症・進展に深く関与することが広く知られている。タンパク質をコードしないRNA、いわゆるノンコーディングRNAが、セントロメアの機能に重要な役割を果たすことが明らかにされているが、その転写制御機構については全く分かっていない。本研究計画では、核に局在するタンパク質であるZfatが、セントロメアにおけるノンコーディングRNAの転写を制御する分子機構を解明し、Zfatの異常とがんとの関連性について明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

The centromere is an essential chromosomal structure for faithful chromosome segregation during cell division. No protein-coding genes exist at the centromeres, but centromeric DNA is actively transcribed into non-coding RNA (ncRNA). This centromeric transcription and its ncRNA products play important roles in centromere functions. However, there is limited understanding regarding the regulation of this process at the molecular level. Here, we report crucial roles of the nuclear zinc-finger protein Zfat in centromeric ncRNA transcription. Zfat specifically binds to 8-bp DNA sequences at the centromere, named the Zfat box. Zfat specifically induces acetylation of lysine 8 in histone H4 (H4K8ac) at the centromere by recruiting the histone acetyltransferase KAT2B. The KAT2B-catalyzed H4K8ac at the centromere functions as a binding-site for the bromodomain-containing protein BRD4, which stimulates RNA polymerase II-dependent ncRNA transcription.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

不活性なクロマチン領域だと考えられていたセントロメアからncRNAが転写されていることが明らかにされて以降、セントロメアの機能および形成過程におけるncRNAの重要性が報告されてきた。しかしながら、その転写制御機構については全く不明であった。また、セントロメアの機能異常とガンとの関連性が報告されているが、その分子メカニズムについても不明であった。本研究により、Zfatによるセントロメアにおける転写制御機構が明らかになり、ZfatがセントロメアncRNA転写に必須の因子として世界で初めて同定された。今後、Zfatが関係するセントロメアの機能異常とガンとの関連性が明らかになることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Death domain-associated protein DAXX regulates non-coding RNA transcription at the centromere through the transcription regulator ZFAT2022

    • Author(s)
      Ishikura Shuhei、Yoshida Kazumasa、Tsunoda Toshiyuki、Shirasawa Senji
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Issue: 11 Pages: 102528-102528

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102528

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CENP-B promotes the centromeric localization of ZFAT to control transcription of noncoding RNA2021

    • Author(s)
      Shuhei Ishikura, Kazumasa Yoshida, Sayuri Hashimoto, Kazuhiko Nakabayashi, Toshiyuki Tsunoda, Senji Shirasawa
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 297(4) Issue: 4 Pages: 101213-101213

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101213

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The transcriptional regulator Zfat is essential for maintenance and differentiation of the adipocytes2021

    • Author(s)
      Shuhei Ishikura Masayoshi Nagai Toshiyuki Tsunoda Kensuke Nishi Yoko Tanaka Midori Koyanagi Senji Shirasawa
    • Journal Title

      Journal of Cellular Biochemistry

      Volume: NA Issue: 6 Pages: 626-638

    • DOI

      10.1002/jcb.29890

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] ZFAT binds to centromeres to control noncoding RNA transcription through the KAT2B-H4K8ac-BRD4 axis2020

    • Author(s)
      Shuhei Ishikura, Kazuhiko Nakabayashi, Masayoshi Nagai, Toshiyuki Tsunoda, Senji Shirasawa
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 48(19) Issue: 19 Pages: 10848-10866

    • DOI

      10.1093/nar/gkaa815

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] DAXXはZFATを介してセントロメアにおけるノンコーディングRNAの転写を制御する2022

    • Author(s)
      石倉 周平、吉田 和真、白澤 専二
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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