Multiomics approach to reveal the molecular pathogenesis of glaucoma utilizing the samples from different genetic background
Project/Area Number |
20K07343
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 49010:Pathological biochemistry-related
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Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
Principal Investigator |
Nakano Masakazu 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (70381944)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田代 啓 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10263097)
徳田 雄市 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40833661)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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Keywords | マルチオミクス / 緑内障 / 人種差 |
Outline of Research at the Start |
緑内障は視野欠損が不可逆的に進行する眼疾患で、本邦では中途失明原因の第1位である。緑内障の一病型である落屑緑内障については、目の組織を構成するエラスチンの重合酵素をコードする遺伝子上の配列の違い(バリアント)が疾患に関連することが報告されている。しかし、そのバリアントの疾患のリスクを規定する配列が日本人と白人とで逆転していることが判明したことから、LOXL1以外の関連分子の存在が示唆された。 そこで本研究では、日本人検体を用いてLOXL1周辺領域の配列情報を精査し新規関連分子を同定した上で、最終的に白人検体由来の配列情報と比較することによって落屑緑内障の発症機序を明らかにすることを目的とする。
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Outline of Final Research Achievements |
Glaucoma is the leading cause of irreversible blindness in Japan. The common variants in LOXL1 are associated with one of the subtypes of glaucoma, exfoliation glaucoma (XFG). However, the risk allele of the exonic variants in LOXL1 have been found to be inverted between Asian and Caucasian populations. Therefore, there should be other genes contributing to the disease pathogenesis. In this study, we are establishing multiomics datasets consisting of genomic and transcriptomic data. As for the genomics, we designed a probe set to enrich the LOXL1 region from the human genome. We also performed a whole-exome association study by utilizing a next generation sequencer. As for the transcriptomics, we are collecting ocular tissues and optimized a protocol to efficiently extract RNA from the tissue. The multiomics datasets of the Japanese XFG patients should be of use to reveal molecular pathogenesis of XFG by comparing with the Caucasian datasets precisely.
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
緑内障は本邦の中途失明原因の第1位であり、40才以上の有病率は5%と高く、この内の9割の症例で自覚症状が無いことが早期診断を妨げている。一方、緑内障は不可逆的に進行するものの、自覚症状のない発症早期に点眼治療を始めれば進行を抑制することが可能であり、失明に至らずに寿命を全うできる。 緑内障のバリアント情報に基づく早期検診法や発症機序解明により新規治療薬が開発できれば、医療費並びに社会福祉関連費の大幅な削減をもたらすと共に、緑内障患者の生活の質が飛躍的に向上することが予想される。
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Report
(4 results)
Research Products
(43 results)
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[Journal Article] Detection of novel and recurrent conjoined genes in non-Hodgkin B-cell lymphoma2021
Author(s)
Matsumoto Y, Tsukamoto T, Chinen Y, Shimura Y, Sasaki N, Nagoshi H, Sato R, Adachi H, Nakano M, Horiike S, Kuroda J, Taki T, Tashiro K, Taniwaki M.
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Journal Title
Journal of Clinical and Experimental Hematopathology
Volume: 61
Issue: 2
Pages: 71-77
DOI
NAID
ISSN
1346-4280, 1880-9952
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Peer Reviewed
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[Presentation] フックス角膜内皮ジストロフィにおけるTCF4アイソフォームの発現変動解析2023
Author(s)
本田徹郎, 奥村直毅, 中川達也, 立石あやな, 山本浩司, Tourtas T, Schlotzer-Schrehardt U, Kruse FE, 徳田雄市, 中野正和, 小泉範子.
Organizer
角膜カンファランス2023
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[Presentation] フックス角膜内皮ジストロフィ患者の角膜内皮におけるTCF4アイソフォームの発現変動の解析2022
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本田徹郎, 奥村直毅, 中川達也, 立石あやな, 山本浩司, Tourtas T, Schlotzer-Schrehardt U, Kruse FE, 徳田雄市, 中野正和, 小泉範子.
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[Presentation] ヒト角膜内皮細胞における遺伝子発現への性別の影響2022
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立石あやな, 奥村直毅, 中川達也, 小森裕也, 花田尚也, Tourtas T, Schlotzer-Schrehardt U, Kruse FE, 徳田雄市, 中野正和, 小泉範子.
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第45回日本分子生物学会年会
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[Presentation] Age-related changes in optic disc morphology over a 10-year period in normal subjects2022
Author(s)
Ikeda Y, Mori K, Yoshii K, Ueno M, Maruyama Y, Nakano M, Sato R, Omi N, Imai K, Yamamoto Y, Mieno H, Tokuda Y, Tashiro K, Sotozono C, Kinoshita S.
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AAO 2022
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Ikeda Y, Mori K, Ueno M, Yoshii K, Nakano M, Sato R, Sato F, Maruyama Y, Omi N, Imai K, Yamamoto Y, Yamasaki T, Tashiro K, Sotozono C, Kinoshita S
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[Presentation] 正常者における前房隅角形状の10年の年代別変化2021
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池田陽子, 森和彦, 吉井健悟, 上野盛夫, 丸山悠子, 中野正和, 佐藤隆一, 大見奈津江, 今井浩二郎、山本雄士, 田代啓, 外園千恵, 木下茂
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[Presentation] Seasonal variation of intraocular pressure in Japanese primary open-angle glaucoma patients2020
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Ikeda Y, Mori K, Ueno M, Yoshii K, Nakano M, Sato R, Maruyama Y, Imai K, Yamamoto Y, Tashiro K, Sotozono C, Kinoshita S.
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池田陽子, 森和彦, 上野盛夫, 吉井健悟, 中野正和, 佐藤隆一, 丸山悠子, 今井浩二郎、山本雄士, 山崎俊秀, 田代啓、外園千恵, 木下茂.
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