| Project/Area Number |
20K07840
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52010:General internal medicine-related
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Hospital Organization Tokyo Metropolitan Komagome Hospital |
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Principal Investigator |
Harada Yuka 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室), 臨床試験科, 部長 (50379848)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
原田 浩徳 東京薬科大学, 生命科学部, 教授 (10314775)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 分子診断 / 骨髄系腫瘍 / 次世代シークエンサー / 遺伝子パネル / 急性リンパ性白血病 / コピー数解析 |
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| Outline of Research at the Start |
白血病などの骨髄系腫瘍は様々な病型があり、原因遺伝子異常や細胞分化段階が異なっていることから治療方法も異なる。したがって病初期の正しい診断が治療成績向上のために非常に重要である。骨髄系腫瘍研究では網羅的遺伝子変異解析や発現解析が盛んに行われて多数の知見が得られているが、臨床実装には程遠い。そこで本研究では、がんゲノム医療拠点病院として、診断・治療選択に直結する遺伝子変異解析検査法の確立を目指し、遺伝子パネル検査を用いた臨床症例の解析から必要十分な解析対象遺伝子を絞り込んだ「骨髄系腫瘍診断検査パネル」を作成する。初発時にこのパネル検査を行うだけで正確な診断と適切な治療選択や予後予測が可能となる。
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| Outline of Final Research Achievements |
Gene mutations are essential determinants in diagnosis of myeloid neoplasms. We performed clinical targeted sequencing using commercially available myeloid panel and a custom-designed panel in 900 cases with myeloid neoplasms. Our improved myeloid panel can provide useful gene information to decide risk classification of myeloid malignancies. We verified that smear samples can be used for clinical molecular diagnosis. Further, we established a method to detect micro copy number alterations from amplicon-based target sequencing. New panels including lymphoid genes are also prepared for diagnosis of lymphoid neoplasms. Thus, comprehensive analysis of gene mutations and copy number alterations can be used for more sophisticated molecular diagnostics.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
遺伝子パネル検査を用いた臨床症例の解析から、必要十分な解析対象遺伝子を絞り込んだ「骨髄系腫瘍診断検査パネル」を作成した。初発時にこのパネル検査を行うだけで、診断に有用な多数の遺伝子情報が得られ、適切な治療選択や予後予測が可能である。また、初診時の保存細胞がなく、すでに治療が行われて腫瘍細胞が得られない場合、初発時の骨髄塗抹標本での遺伝子パネル解析も可能であり、移植適応判断等に有用である。これまでの単一遺伝子変異解析に取って代わるだけでなく、染色体検査や白血病キメラスクリーニング検査に匹敵する検査法を確立できたと考える。
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