| Project/Area Number |
20K07893
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52020:Neurology-related
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| Research Institution | Juntendo University |
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Principal Investigator |
Nishioka Kenya 順天堂大学, 医学部, 先任准教授 (40348933)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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| Keywords | Parkinson's disease / Whole genome sequencing / Long read sequencing / Whole exome sequencing / 家族性パーキンソン病 / 臨床遺伝学 / 遺伝子 / 全ゲノムシーケンス / 全エクソームシーケンス / パーキンソン病 / 遺伝子変異 / 次世代シーケンサー |
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| Outline of Research at the Start |
パーキンソン病（PD）は、神経変性疾患では、アルツハイマー病に次いで多い。これまでに遺伝性PDの研究から同定された遺伝子群は、Genome-wide association studyを用いた大規模メタ解析にて、孤発型PDにも強く関連することが証明されている。今回代表者は常染色体優性遺伝形式をとり、既知の遺伝子変異を持たないPD の一家系に注目し、全ゲノムシーケンスを施行し、１つの病的候補遺伝子Xまで絞り込めている。今後はその遺伝子の機能解析に移行し、その遺伝子が真に病的なものかどうかの立証作業を進める。最終目標は、新規病的遺伝子の単離を目指し、その分子病態の全貌を解明する。
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| Outline of Final Research Achievements |
We performed the DNA analyses for a familial Parkinson's disease (PD) with autosomal dominant inheritance, along with targeted sequencing, whole genome sequencing and whole exome sequencing. We identified six candidate genes (FSD1，CDRT15L2，AP2A2, TALDO1, SLC22A3, FBLN2), however our additional analyses did not prove the pathogenicity among them. Next, we aim to analyze structural variants using long read sequencing, collaborating with Yokohama city university.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
三世代に渡り同一家系内に濃厚な発症者をもつ一家系に焦点を絞り，解析を行った。Whole genome sequencingとwhole exome sequencingを用いて候補領域を同定し，また候補となった遺伝子には，DNA bankからのサンプルとtargeted resequencingを施行したが，病的遺伝子の同定には至らなかった。点変異では説明の付かない変異の可能性を考え，次に構造多型に注目し，現在PacBio社のSequel IIシークエンサーを利用したLong Read Sequencingを行っている。新たなパーキンソン病の原因遺伝子の同定に向けて解析を行っている。
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