Project/Area Number |
20K08568
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53030:Respiratory medicine-related
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Research Institution | Tottori University |
Principal Investigator |
高田 美也子 鳥取大学, 医学部, 助教 (50523643)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山口 耕介 鳥取大学, 医学部附属病院, 講師 (60529402)
千酌 浩樹 鳥取大学, 医学部附属病院, 教授 (90283994)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
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Keywords | 腸内細菌叢 / 非結核性抗酸菌症 / NGS / メタゲノム解析 |
Outline of Research at the Start |
近年、非結核性抗酸菌(NTM)による感染症が本邦だけでなく世界的にも増加傾向にある。非結核性抗酸菌は土壌や河川、海水などの自然界及び浴室等の日常環境に常在する細菌であり、誰でも曝露されうる可能性があるが、発症者の原因を説明する機序は明らかになっていない。本研究では非結核性抗酸菌症を発症された患者さんにおける、腸内細菌叢の変化と宿主のNK細胞機能に与える影響を調べることにより、非結核性抗酸菌症の感受性因子となりうるかを検討する。
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Outline of Annual Research Achievements |
結核の減少傾向とは逆に非結核性抗酸菌症(NTM)による感染症が増加傾向にある。その中で起炎菌として最も多いのがM. avium complex (MAC),次にM. kansasii,さらにM. abscessusである。これらの細菌は土壌や河川などの自然界、あるいは浴室などの水回りに生育する環境菌であるため、誰でも吸入曝露する可能性があるが、感受性のある宿主にだけ感染し得ると考えられている。したがってどのような宿主が感受性に関与するか(感受性因子の同定)は本症の診断や治療にとって非常に重要であるが現在のところ明らかな機序は見つかっていない。近年、腸内細菌のメタゲノム解析により、腸内細菌叢がNK細胞機能に影響を与えていることの報告が報告されている。これまで、筆者らのグループはNK細胞機能を負にする液性分子として可溶性ULBP-2の研究を行ってきており、本課題では、非結核性抗酸菌症の発症に、宿主の免疫力の低下によるものかを調べるため、腸内細菌叢とNK細胞機能、そしてその調節因子である可溶性ULBP-2との関連について検討を行っている。本年はNTM患者の治療前の腸内細菌叢を次世代シークエンサー(NGS)解析を行った中で、ロングリードシークエンサー及びショートリードシークエンサーにより解析し、患者群の腸内細菌叢組成に関する有用な知見を得た。また同時に、可溶性ULBP2測定のために患者群の血清を採取し保存を行った。さらに、各種ELISAを検証し、患者血清において、もっとも最適な可溶性ULBP2の測定系の選択し、測定の前検討を行った。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
腸内細菌叢、口腔内細菌叢における次世代シークエンス(NGS)の手法については、従来より多用されているショートリードシークエンサーに加え、ロングリードシークエンサーによる結果を比較した。これにより、シークエンサーの種類や、解析手法の違いによる結果の差などについての知見を得た。本知見は、今後の腸内細菌叢解析手法の最適化を図る上で、非常に有用である。また可溶性ULBP2の測定については、より感度の高いキットを選定し、安定した検出が可能となる条件を決定するなどの、予備的検討を行うことができた。
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Strategy for Future Research Activity |
非結核性抗酸菌症患者の腸内細菌叢の治療前後についての変化、及び健常者との比較を行う。方法としては、腸内細菌叢解析についてはNGSを用いて、最適化した条件で、糞便、唾液(糞便の代用としての可能性があるため)についてのメタゲノム解析を行う。また、患者群、健常者群の可溶性ULBP-2を、選択した高感度のELISA法にて測定する。対象者のNK細胞機能は末梢血を用いたフローサイトメトリーによる測定も行う。
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Report
(3 results)
Research Products
(1 results)