Project/Area Number |
20K08604
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53040:Nephrology-related
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
三村 維真理 東京大学, 医学部附属病院, 特任講師 (00727084)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
南学 正臣 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (90311620)
田中 哲洋 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (90508079)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2024: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
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Keywords | ヒストン修飾 / 腎線維化 / 尿細管間質 / 線維化 / ヒストン / 慢性腎臓病 |
Outline of Research at the Start |
ヒストン修飾H3K27が腎線維化の進行の分子メカニズムにどのように寄与しているかについて明らかにするため、H3K27の脱メチル化酵素UTX/JMJD3の阻害薬であるGSKJ4を腎不全モデル動物に投与して実験する。GSKJ4を投与すると、αSMAをはじめとした線維化関連遺伝子の発現が抑制されるが、それらのサンプルを用いてRNA-seqを行い、遺伝子発現変化およびlncRNAの発現変化を網羅的に解析する。その結果を用いて線維化進行に伴い変化する重要なlnc RNAを同定し、ヒストン修飾酵素との関連を明らかにしたいと考えている。
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Outline of Annual Research Achievements |
申請者は、ヒストン修飾酵素阻害薬の1つであるGSK4Jが尿細管間質の線維化に与える影響について調べている。GSKJ4はKDM6A(Lysine(K) demethyltase 6A、別名UTX:Ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat, X chromosome)およびKDM6B(Lysine demethylase 6B、別名JMJD3:jumonji domain-containing protein 3)を阻害する薬理作用を有する。GSKJ4はH3K27のメチル化を促進させ、その標的遺伝子群の発現を抑制する作用をもつ。申請者は、ラット線維芽細胞株であるNRK49Fに線維化刺激であるTGFβおよびGSKJ4の標的であるKDM6BをsiRNAによりノックダウンさせた際の遺伝子発現変化をNRK49FからmRNAを抽出し、先進ゲノム支援の支援を受けながらRNA-seqを行った(N=3)。その結果、TGFβによる刺激で576の遺伝子が有意に上昇する閾値に対して、KDM6Bのノックダウンにより発現が低下した遺伝子は26個認められた。以前に申請者がおこなったNRK49Fに対してTGFβ刺激後、GSK-J4を投与した実験でTGFβを投与すると208個の遺伝子が発現上昇し、さらに、GSKJ4を投与するとTGFβによる発現上昇あるいは発現低下が有意にキャンセルされる113個の遺伝子群を同定した。KDM6Bの下流遺伝子26個とGSK-J4の下流遺伝子113個を比較すると7つの遺伝子が共通して認められた。その中にはActa2(αSMA)など線維化に関与する遺伝子が含まれていた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
網羅解析結果をまとめて、論文投稿準備中である。
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Strategy for Future Research Activity |
KDM6BをノックダウンしたときにTGFβ刺激による発現変動がキャンセルされる遺伝子群とGSKJ4によって影響を受ける遺伝子群の比較で共通した7つの遺伝子群にKDM6bがリクルートされてH3K27me3が変化しているかどうかを明らかにする。H3K27me3の抗体を用いたクロマチン免疫沈降を行い、H3K27me3のChIP-qPCRをおこなう。これらの成果は国内外での学会発表および学術論文として発表する。
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