皮膚微小環境において極小マイクロバイオームが果たす役割の解明
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20K08669
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 53050:Dermatology-related
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
中島 沙恵子 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 (70574408)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中川 一路 京都大学, 医学研究科, 教授 (70294113)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 皮膚マイクロバイオーム / 極小マイクロバイオーム / 汗腺 / レーザーキャプチャーマイクロダイセクション |
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| Outline of Research at the Start |
皮膚表面に存在する微生物叢（皮膚マイクロバイオーム）解析の解像度は未だ皮膚全体にとどまっており、汗腺・脂腺・毛包といった皮膚微小構造物レベルでの解析は進んでいません。そこで、本研究では、レーザーキャプチャーマイクロダイセクションという技術を用いて、これまで皮膚という臓器全体として解析されてきた皮膚マイクロバイオームを汗腺や脂腺といった皮膚の微小構造物ごとに細分化し明らかにします。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本申請研究では、汗腺や脂腺、毛包といった皮膚付属器周辺の極小皮膚マイクロバイオームの詳細を明らかにし、さらにこの極小皮膚マイクロバイオームの炎症性皮膚疾患の病態への関与について明らかにすることを目標としている。皮膚付属器周辺のマイクロバイオーム解析については、レーザーキャプチャマイクロダイセクションにてパラフィン切片より付属器周辺の組織を切り出し、バクテリアDNA抽出を行った。抽出したバクテリアDNAを用いてメタゲノムシーケンス解析を行い、皮膚付属器周辺の皮膚マイクロバイオームに関するデータを得ることができた。しかしながら、本来ネガティブコントロールサンプルであるべきパラフィン切片単独サンプル（皮膚組織を含まない）からもバクテリアDNAが検出されたため、現在、パラフィン切片単独サンプルで検出された細菌情報をバックグランドとして処理することで妥当なデータが得られるかについて検討を行っている。バックグラウンド処理により妥当なデータが得られるようであれば、そのままデータ解析を進め、論文化を目指す。もし、バックグラウンド処理がうまくいかないようであれば、パラフィン処理工程でのコンタミネーションがどこで発生しているのかについて検討を行い、工程の改善を行う。また、本年はヒト汗腺組織についての詳細な検討をシングルセルRNAシーケンスで行い、汗腺組織における細胞群を明らかにし、その機能について検討を行った(doi: 10.1016/j.jid.2023.11.013.)。今後、汗腺組織周辺のマイクロバイオームと汗腺組織細胞群がどのように関与し、恒常性の維持・発汗機能などに関与しうるかについても検討を行っていきたいと考えている。
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Report
(4 results)
Research Products
(1 results)
