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Structural analysis of the MMSET-nucleosome complex involved in blood cancers by cryo-electron microscopy

Research Project

Project/Area Number 20K08717
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

SATO Ko  横浜市立大学, 医学部, 助教 (90300962)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywordsエピジェネティクス / ヒストンメチル化 / ヌクレオソーム / クライオ電子顕微鏡 / MMSET / NSD2 / cryo-EM
Outline of Research at the Start

多発性骨髄腫(MM)や急性リンパ性白血病(ALL)ではヌクレオソーム修飾酵素MMSETタンパク質の過剰な発現や突然変異によってヌクレオソームが過剰に修飾された結果、遺伝子の発現に異常が起こることが病因となっている例が報告されている。本研究では正常型及び変異型MMSETタンパク質とヌクレオソーム複合体の立体構造をクライオ電子顕微鏡を用いて明らかにすることによって、MMSETタンパク質の酵素活性制御機構を解明する。

Outline of Final Research Achievements

The histone methyltransferase MMSET activates gene transcription by dimethylated lysine 36 of histone H3. 20% of multiple myeloma patients show increased amounts of MMSET protein, and some cancers have mutations in MMSET that abnormally increase their activity. In this study, we analyzed the three-dimension structure of MMSET in complex with nucleosome by single-particle analysis of MMSET using cryo-EM. We clarified the mechanism that regulates its methylation activity.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

MMSETは本来基質が結合するクレフトに自己阻害ループがフタをするように結合することで基質との結合がある程度制限されている。一方、E1099KやT1150Aのようながん化型のアミノ酸変異体は、自己阻害ループのフタをする力が弱いため、高いメチル化活性を示すことが立体構造レベルで明らかとなった。この成果は、がん化型MMSETによる調節機構の破綻を回避し、適切な活性制限効果を取り戻すような分子標的薬を設計するための立体構造基盤を提供するものである。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2021 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structural basis of the regulation of the normal and oncogenic methylation of nucleosomal histone H3 Lys36 by NSD22021

    • Author(s)
      Sato Ko、Kumar Amarjeet、Hamada Keisuke、Okada Chikako、Oguni Asako、Machiyama Ayumi、Sakuraba Shun、Nishizawa Tomohiro、Nureki Osamu、Kono Hidetoshi、Ogata Kazuhiro、Sengoku Toru
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 6605-6605

    • DOI

      10.1038/s41467-021-26913-5

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Remarks] ヒストンメチル化酵素NSD2は発がん性変異により安全装置が外れ、制御不能になる

    • URL

      https://www.yokohama-cu.ac.jp/news/2021/202111sengoku_nc.html

    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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