空間的トランスクリプトミクスによる食道癌微小環境の遺伝子発現マッピング

• Project/Area Number: 20K09080
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: 井上 重隆 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (00529802)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 白羽根 健吾 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (10529803) ; 岩本 千佳 九州大学, 大学病院, 特任助教 (10752842) ; 大内田 研宙 九州大学, 大学病院, 講師 (20452708)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2020)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
• Keywords: 食道癌 / 腫瘍微小環境 / シングルセル解析 / 遺伝子発現地図

Outline of Research at the Start

癌の浸潤・転移機構については、腫瘍微小環境が大きな役割を果たしていると考えられているが未だ十分に解明されていない。今回、新技術”Visium”(10X genomics社)により遺伝子発現情報をその位置情報を維持したまま、単一細胞レベルの遺伝子発現やタンパクの解析が可能となった。本研究ではその新技術を利用することで食道癌微小環境に対し、従来の病理形態学と密に情報をマッチさせた遺伝子発現地図を作成し、腫瘍微小環境における機能をマッピングすることによって、微小環境の機能に関する理解を深め、癌の浸潤・転移機構等の解明を目指す。