Epigenetic real-time monitoring of head and neck cancer
Project/Area Number |
20K09689
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 56050:Otorhinolaryngology-related
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Research Institution | Hamamatsu University School of Medicine |
Principal Investigator |
三澤 清 浜松医科大学, 医学部, 教授 (90334979)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
今井 篤志 浜松医科大学, 医学部附属病院, 講師 (30794309)
望月 大極 浜松医科大学, 医学部附属病院, 助教 (40467246)
山口 裕貴 浜松医科大学, 医学部附属病院, 診療助教 (60837821)
石川 竜司 浜松医科大学, 医学部, 助教 (90436931)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2021: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
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Keywords | エピゲノム動態 / リキッドバイオプシー / リアルタイムモニター法 / クロマチン動態 / 頭頸部癌 / 原発不明癌 |
Outline of Research at the Start |
①5hmCのゲノム上の分布情報をTAB-Seq法によって調べる。②クロマチン動態に焦点をあてたエピゲノム状態を調べる。③リキッドバイオプシーによるリアルタイムモニタリング法を確立する。この3つの研究により、Epigenetic inactivationとactivationの両面からのアプローチによる頭頸部癌におけるエピゲノム機構の解明とリアルタイムモニター法の確立を目指す。頭頸部癌の新規治療法の確立、早期癌の発見につながるモニター法の開発を目指す。
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Outline of Annual Research Achievements |
DNAのメチル化を始めとするエピジェネティックな変化が、RNA合成、ひいてはタンパク質の発現を抑制することから、癌化メカニズムの一つとして広く認識されている。また、癌細胞の不均一性獲得は、エピゲノムによる可塑性に起因するとされている。申請者は、「頭頸部癌におけるエピゲノム解析」に関する研究を継続的に行い、最近は、「脱メチル化機構」に関する報告を行っている。これまで、DNAメチル化、ヘテロクロマチンなどの“Epigenetic inactivation”に関する研究が盛んに行われてきたが、近年は、“Epigenetic activation”という視点での研究が注目されている。このactivationの機序には、DNA脱メチル化酵素TETによるDNA脱メチル化と、クロマチン構造の動的な変化によるスーパーエンハンサー出現などによる転写亢進などがあげられる。 今回、Epigenetic inactivationとactivationの両面からのアプローチによる頭頸部癌におけるエピゲノム機構の解明とリアルタイムモニター法の確立を目指すことを目標としている。 本年度も、昨年と同様に、リキッドバイオプシー検体を69サンプル収集した。中咽頭癌、口腔癌を中心にリアルタイムがエピゲノム動態を評価するために定期的に採血し検体を収集した。再発症例を中心に解析を進めた。本年度は、原発不明癌のリキッドバイオプシーによる原発部位の特定のための研究を行った。研究期間を1年延長し、リキッドバイオプシーによる頭頸部癌の病勢の把握の手法の研究を続ける。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
リキッドバイオプシーによる血液循環DNAのメチル化解析は順調に進んでいる。昨年度は、原発不明癌のサンプル収集とリアルタイムメチル化解析を行い原発部の特定に重要な結果を得ることができた。今後も解析をすすめていく予定である。
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Strategy for Future Research Activity |
①5hmCのゲノム上の分布情報をTAB-Seq法によって調べる。②クロマチン動態に焦点をあてたエピゲノム状態を調べる。③リキッドバイオプシーによるリアルタイムモニタリング法を確立する。この3つの研究により、Epigenetic inactivationとactivationの両面からのアプローチによる頭頸部癌におけるエピゲノム機構の解明とリアルタイムモニター法の確立を目指している。頭頸部癌の新規治療法の確立、早期癌の発見につながるモニター法の開発につながるように研究をすすめていく。
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Report
(3 results)
Research Products
(20 results)
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[Journal Article] Repression of DERL3 via DNA methylation by Epstein-Barr virus latent membrane protein 1 in nasopharyngeal carcinoma2022
Author(s)
Kondo S, Okabe A, Nakagawa T, Matsusaka K, Fukuyo M, Rahmutulla B, Dochi H, Mizokami H, Kitagawa Y, Kurokawa T, Mima M, Endo K, Sugimoto H, Wakisaka N, Misawa K, Yoshizaki T, Kaneda A.
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Journal Title
Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease
Volume: 1869(2)
Issue: 2
Pages: 166598-166598
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Neuropeptide receptor genes GHSR and NMUR1 are candidate epigenetic biomarkers and predictors for surgically treated patients with oropharyngeal cancer.2020
Author(s)
Misawa K, Mima M, Yamada S, Misawa Y, Imai A, Mochizuki D, Nakagawa T, Kurokawa T, Oguro M, Ishikawa R, Yamaguchi Y, Endo S, Kawasaki H, Kanazawa Takeharu and Mineta H
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Journal Title
Scientific Reports
Volume: 10(1)
Issue: 1
Pages: 1007-1007
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] G protein-coupled receptor genes, PTGDR1, PTGDR2, and PTGIR, are candidate epigenetic biomarkers and predictors for treated patients with HPV-associated oropharyngeal cancer.2020
Author(s)
Misawa K, Imai A, Kanazawa T, Mima M, Yamada S, Misawa Y, Mochizuki D, Yamada T, Shinmura D, Ishikawa R, Kita J, Yamaguchi Y, Misawa Y and Mineta H
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Journal Title
Microorganisms
Volume: 8(10)
Issue: 10
Pages: 1504-1504
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Identification of novel methylation markers in HPV-associated oropharyngeal cancer: genome-wide discovery, tissue verification and validation testing in ctDNA.2020
Author(s)
Misawa K, Imai A, Matsui H, Kanai A, Misawa Y, Mochizuki D, Mima M, Yamada S, Kurokawa T, Nakagawa T and Mineta H
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Journal Title
Oncogene
Volume: 39(24)
Issue: 24
Pages: 4741-4755
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Long interspersed nuclear element 1 hypomethylation has novel prognostic value and potential utility in liquid biopsy for oral cavity cancer.2020
Author(s)
Misawa K, Yamada S, Mima M, Nakagawa T, Kurokawa T, Imai A, Mochizuki D, Shinmura D, Yamada T, Kita J, Ishikawa R, Yamaguchi Y, Misawa Y, Kanazawa T, Kawasaki H and Mineta H
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Journal Title
Biomarker Research
Volume: 8
Issue: 1
Pages: 53-53
DOI
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Peer Reviewed / Open Access
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