歯周病原因菌の病原性因子及び挿入配列を制御するsmall RNAの解析
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20K09922
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 57020:Oral pathobiological science-related
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| Research Institution | Kagoshima University |
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Principal Investigator |
大貝 悠一 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 講師 (40511259)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中田 匡宣 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 教授 (90444497)
小松澤 均 広島大学, 医系科学研究科(歯), 教授 (90253088)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 歯周病原因菌 / sRNA / small RNA / 挿入配列 |
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| Outline of Research at the Start |
歯周病原因菌のひとつであるAggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa)のsmall RNA (sRNA)を介した病原性因子及び挿入配列の発現制御を解明する。インシリコ解析によるターゲット予測によりsRNAによる発現制御が考えられるターゲット遺伝子において、合成RNAを用いたsRNA結合性解析、sRNA欠損株等を用いた各種解析を行う。また、sRNAの同定がなされていない歯周病原因菌においては次世代シークエンサーを用いたRNA-seq解析によりsRNAの網羅的な新規同定を行う。
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| Outline of Annual Research Achievements |
歯周病原因菌のひとつであるAggregatibacter actinomycetemcomitansのsmall RNAを介した病原性因子などの発現性の解析を目的とし、RNAシャペロンのひとつでありsmall RNAを介した発現制御に関与する因子であるhfqの欠損株、外環境の刺激に応答し各種遺伝子やsmall RNAの制御を担う二成分制御系因子の欠損株を作成し、病原性や遺伝子発現性の解析を行った。
hfq欠損株は一部の菌株において著しいバイオフィルム形成量の減少を示した。当欠損株を用いたRNAseq解析は野生株の比較し、細胞への付着やバイオフィルム形成との関連が示唆されている因子の発現変動を確認した。
一部の二成分制御系因子の欠損株においてはヒト培養細胞への付着性、酸化ストレスに対する抵抗性に変動を認めた。酸化ストレスに変動を示す二成分制御系欠損株(arcA欠損株)においては、RNA-seq解析により酸化ストレスへの耐性に関与することが考えられる遺伝子の発現変動を確認した。また、同欠損株を菌体総タンパクを用いた二次元電気泳動法により細胞内代謝系に関与するLpdAの発現変動が確認された。
今後、これらの遺伝子発現制御にsmall RNAが関与する可能性を検討し、Aggregatibacter actinomycetemcomitansの病原性や生体内定着性に関わる新たな遺伝子発現制御メカニズムを解析する予定である。
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Report
(4 results)
Research Products
(3 results)
