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Analyses of secondary structural changes of chromatin during DNA damage repair using synchrotron circular dichroism spectroscopy

Research Project

Project/Area Number 20K12164
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 63020:Radiation influence-related
Research InstitutionNational Institutes for Quantum Science and Technology

Principal Investigator

Izumi Yudai  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 主任研究員 (20595772)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
KeywordsDNA損傷応答 / クロマチン / ヒストン / 円二色性 / 放射光 / DNA損傷
Outline of Research at the Start

DNAとタンパク質の複合体であるクロマチンは、DNA損傷修復過程において、修復タンパク質が損傷個所にアクセスしやすいようにその姿を変え、修復が完了すれば、元に戻ると考えられている。しかしながら、その構造変化過程は未解明の部分が多い。
本研究では、DNA損傷を起点としたクロマチンの構造変化を放射光円二色性分光測定により明らかにし、構造生物学的な観点からDNA損傷修復機構の全容解明に資するデータを得る。

Outline of Final Research Achievements

Secondary structure contents of histone H2A-H2B proteins extracted from heated cells were analyzed using synchrotron radiation circular dichroism (CD) spectroscopy to confirm the effects of cell heating on the histone structures. The CD spectra of histone H2A-H2B extracted from the cells heated at 45 and 60°C differed from those of H2A-H2B both native and denatured in vitro. It indicates that the structural changes of H2A-H2B, which differed from the ordinary thermal denaturation, were induced. The duration of the altered structures seemed to correlate with that of the heat-induced DNA lesions. The structural alterations of H2A-H2B might be induced by cellular functions to resist heat-induced DNA lesions, such as DNA damage repair pathways.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、被加熱細胞由来のヒストンH2A-H2Bの構造が通常のH2A-H2Bおよび試験管内で熱変性させたそれとは異なっていることを初めて示した。これは、細胞内タンパク質の熱ストレスに対する振る舞いは、試験管内の実験のみでは明らかにできないことを示唆する。この知見は、タンパク質研究の発展に寄与するところが大きいと考えられる。また、本研究で扱った温度領域は、がん治療法の一つである温熱療法で用いられるものと同等であり、本研究で確立した測定手法や得られた知見は、温熱療法の作用機序の理解、治療効果の向上に資するものと期待される。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Secondary structural analyses of histone H2A-H2B proteins extracted from heated cells2023

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo, A. Yokoya
    • Journal Title

      Chirality

      Volume: 35 Issue: 3 Pages: 165-171

    • DOI

      10.1002/chir.23529

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 加熱細胞由来ヒストンH2A-H2Bの円二色性測定2024

    • Author(s)
      泉 雄大、松尾光一、横谷明徳
    • Organizer
      第37回日本放射光学会年会 放射光科学合同シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Secondary structural analysis of histone H2A-H2B proteins extracted from heated cells2023

    • Author(s)
      Y. Izumi, K. Matsuo, and A. Yokoya
    • Organizer
      19th International Conference on Chiroptical Spectroscopy (CD2023)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 加熱ヒトがん細胞由来ヒストンH2A-H2Bの円二色性構造解析2022

    • Author(s)
      泉 雄大
    • Organizer
      第26回HiSOR研究会~生体分子の構造機能研究におけるキラル分光の新しい可能性~
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 温熱処理した細胞から抽出したヒストンの円二色性測定2021

    • Author(s)
      泉 雄大、松尾 光一、横谷 明徳
    • Organizer
      第34回日本放射光学会年会 放射光科学合同シンポジウム
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 細胞加熱によって生じるヒストンH2A-H2Bの熱変性とは異なる構造変化2020

    • Author(s)
      泉 雄大、松尾 光一、横谷 明徳
    • Organizer
      量子生命科学会第2回大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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