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Analysis of effects of flask gas phase on microorganisms during shaking culture and proposal of new shaking culture method

Research Project

Project/Area Number 20K15097
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

Takahashi Masato  筑波大学, 生命環境系, 研究員 (60826965)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords液内振盪培養 / 振盪フラスコ培養法 / モニタリングデバイス / 二酸化炭素換気能 / 酸素供給能 / 微生物 / ガス制御 / 酸素換気能 / ガス制御システム / 好気的液内培養 / 二酸化炭素 / 微生物群集
Outline of Research at the Start

微生物を用いたバイオ生産技術の開発や改善を図るうえで、作業しやすいスケールで低コストかつ多検体を検討できる振盪フラスコ培養法は重要な液体培養技術である。申請者は、振盪フラスコ培養中の微生物群集構造が、培養中に行う通常のサンプング操作の有無によって異なるという現象を見出した。興味深いことに、サンプリング過程の無菌的な培養栓の開封を繰り返した条件で集積した微生物群集の中には、複数種の培地検討だけでは集積しなかった特異的な微生物の存在を認めている。この現象と向き合い、本研究では、『従来法で設定できる培養環境の明確化』および、『未開拓の培養環境の創出』をおこなう。

Outline of Final Research Achievements

This study was challenged to "clarify the conventional culture environment" and "create the unexplored culture environment". In order to understand the microbial culture environment that can be set by the conventional shake-flask culture conditions, the oxygen (O2) supply capacity and carbon dioxide (CO2) ventilation capacity of various flask conditions, focusing on the shape of the flasks and the type of culture-stoppers were quantified. As a result, it was cleared that CO2 ventilation capacity was much smaller than O2 supply capacity during shaking culture used by Erlenmeyer flasks and Sakaguchi flasks. Therefore, novel device was developed for enhancing ventilation to shake-flask systems. The small device does not require additional electrical power.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

振盪フラスコ培養法は、微生物を用いた生産技術の開発や改善を図るうえで、作業しやすいスケールで低コストかつ多検体を検討できる重要な液内培養技術である。これまで意図せず換気不十分で使用されてきたため、非意図的な二酸化炭素の影響が潜在していたことが明らかとなった。開発した小型の換気デバイス(外部電力が不要で、フラスコを設置する振盪基盤のデッドスペースに外付けできる)を付与することで、液内振盪培養中のフラスコ気相部の培養環境を制御でき、バイオプロセス開発上流の培養条件の検討や、培養を介した微生物種および物質生産のスクリーニングに期待できる。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Development of a bellows pumping device for enhancing ventilation to shake-flask systems2021

    • Author(s)
      Masato Takahashi, Hideki Aoyagi
    • Journal Title

      Biochemical Engineering Journal

      Volume: 174 Pages: 108098-108098

    • DOI

      10.1016/j.bej.2021.108098

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis and effect of conventional flasks in shaking culture of Escherichia coli2020

    • Author(s)
      Masato Takahashi, Hideki Aoyagi
    • Journal Title

      AMB Express

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 1-6

    • DOI

      10.1186/s13568-020-01013-7

    • NAID

      120007146575

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Analysis of the influence of flame sterilization included in sampling operations on shake-flask cultures of microorganisms2020

    • Author(s)
      Masato Takahashi, Takafumi Honzawa, Ryuichi Tominaga, Hideki Aoyagi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/s41598-020-66810-3

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Analysis of porous breathable stopper and development of PID control for gas phase during shake-flask culture with microorganisms2020

    • Author(s)
      Masato Takahashi, Hideki Aoyagi
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology

      Volume: 104 Issue: 20 Pages: 8925-8936

    • DOI

      10.1007/s00253-020-10847-x

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] これまで気づかなかったフラスコスケールの振盪培養法の実態2022

    • Author(s)
      高橋 将人
    • Organizer
      日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会 第5回講演会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 微生物培養におけるフラスコスケールの高性能な流加システムの開発2022

    • Author(s)
      加藤 拓也, 高橋 将人, 青柳 秀紀
    • Organizer
      第10回日本生物工学会東日本支部コロキウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] サンプリング過程に含まれる火炎殺菌操作が微生物の振盪 フラスコ培養に及ぼす影響の解析2021

    • Author(s)
      高橋 将人, 青柳 秀紀
    • Organizer
      第73回日本生物工学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 振盪フラスコ培養中の気相環境の解析と利用2021

    • Author(s)
      高橋 将人
    • Organizer
      日本生物工学会東日本支部 賀詞交換会 日本生物工学会東日本支部長賞記念講演
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] TSUKUBA JOURNAL 微生物培養中のサンプリング操作は増殖に影響を及ぼす

    • URL

      https://www.tsukuba.ac.jp/journal/biology-environment/20200630180048.html

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] 日本の研究com. プレスリリース

    • URL

      https://research-er.jp//articles/view/90047

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] 公益社団法人 日本生物工学会 東日本支部 第5回(2020年)日本生物工学会東日本支部長賞 受賞

    • URL

      https://www.sbj.or.jp/branch/branch_higashinihon_award.html

    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2023-01-30  

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