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Analysis of the mechanical property of nanofiber protein AtaA

Research Project

Project/Area Number 20K15098
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

Yoshimoto Shogo  名古屋大学, 工学研究科, 特任助教 (90806291)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywordsタンパク質 / 原子間力顕微鏡 / 1分子解析 / ナノ力学 / オートトランスポーター
Outline of Research at the Start

アシネトバクター属細菌由来のナノファイバータンパク質AtaAは、プラスチック、ガラス、金属など様々な材料表面に対し水中で高い接着性を示すため、新規のバイオ材料固定化マテリアルとして期待される。最近、AtaAが他のタンパク質とは異なるユニークな粘弾性を示すことが分かってきた。本研究では、AtaAの粘弾性がどのようにして発揮されるのかを、原子間力顕微鏡を用いた解析と計算により分子レベルで明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we analyzed the nanomechanical properties of the nanofiber protein AtaA using atomic force microscopy and molecular dynamics simulations with the aim of elucidating the mechanism of viscoelasticity of AtaA. As a result, we found that tough domains exist in AtaA, and that these mechanical properties are based on the precisely designed three-dimensional structure of the protein.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

AtaAの粘弾性発現機構が明らかになることで、望みのナノ力学特性をもった人工タンパク質をタンパク質工学により設計、作出可能になる。その結果、タンパク質を原料とした構造材料や水中接着剤の開発につながり、低炭素社会や循環型社会の実現に貢献できると考えられる。

Report

(2 results)
  • 2021 Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2020

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] The extracellular juncture domains in the intimin passenger adopt a constitutively extended conformation inducing restraints to its sphere of action2020

    • Author(s)
      Weikum Julia, Kulakova Alina, Tesei Giulio, Yoshimoto Shogo, Jaegerum Line Vejby, Schutz Monika, Hori Katsutoshi, Skepo Marie, Harris Pernille, Leo Jack C., Morth J. Preben
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 21249-21249

    • DOI

      10.1038/s41598-020-77706-7

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分子動力学計算を用いた細菌表層テザータンパク質の力学応答解析2020

    • Author(s)
      橋本貴幸, 笹原 純, 吉本将悟, 堀 克敏
    • Organizer
      生物工学会若手研究者の集い 第三回オンラインセミナー
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-12-25  

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