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13C-metabolic flux analysis and fate control for differentiatable cells

Research Project

Project/Area Number 20K15100
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Okahashi Nobuyuki  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 准教授 (30802748)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords13C代謝フラックス解析 / 細胞分化 / 分化制御 / 中心炭素代謝 / 補酵素バランス
Outline of Research at the Start

未分化細胞を特定の細胞へと自在に分化させる技術は、再生医療の産業化を実現するために必須である。申請者は、細胞が分化する前後でエネルギー代謝を大きく変化させることに注目し、代謝面からの細胞分化をコントロールできるのではないかと考えた。本研究では、分化前後の血球系細胞を対象とし、申請者がこれまで構築してきた13C代謝フラックス解析法を使って、代謝の変化を直接的かつ定量的に捉える。これによって、細胞の代謝と分化の関係性を明らかにし、さらに、代謝に介入することで分化方向性を外的に制御する技術開発に取り組む。

Outline of Final Research Achievements

The development of technology to induce differentiation into cells with specific functions is an important issue in regenerative medicine. In this study, we developed 13C metabolic flux analysis, which can measure metabolic reaction rate, to quantitatively compare the metabolic state of cells before and after differentiation. The metabolic models of HL-60, a neutrophil-like cell line, and THP-1, a macrophage-like cell lines were examined. Then flux distribution before and after differentiation was successfully calculated using the developed model. Furthermore, we showed that cell differentiation can be externally controlled by inhibiting reactions activated during differentiation.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で最適化した13C代謝フラックス解析法は、これまで不明であった終末分化した細胞の代謝状態を定量的に明らかできる点で新規性があり、分化前後での細胞の代謝の変化をフラックスレベルで明らかにした先駆的な事例である。今後、分化する他の種類の細胞の代謝の変化を計測するための基盤技術としての活用が見込まれ、細胞分化のメカニズム解明や、再生医療などにおける細胞の分化制御に貢献できる可能性がある。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Isotope Calculation Gadgets: A Series of Software for Isotope-Tracing Experiments in Garuda Platform2022

    • Author(s)
      Okahashi Nobuyuki、Yamada Yuki、Iida Junko、Matsuda Fumio
    • Journal Title

      Metabolites

      Volume: 12 Issue: 7 Pages: 646-646

    • DOI

      10.3390/metabo12070646

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 好中球の活性酸素種産生能の制御に向けた中心炭素代謝経路の定量解析法の構築2022

    • Author(s)
      谷口赳夫 岡橋伸幸 松田史生
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 代謝の”流れ”を観る2022

    • Author(s)
      岡橋伸幸
    • Organizer
      AgTechセミナー
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      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 質量分析法を用いた分化前後のヒト単球細胞株THP1の13C代謝フラックス解析2021

    • Author(s)
      本谷真奈, 谷口赳夫, 岡橋伸幸, 松田史生
    • Organizer
      第69回質量分析総合討論会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Quantifying central carbon metabolism in neutrophils by using 13C-metabolic flux analysis2021

    • Author(s)
      Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda
    • Organizer
      Metabolic engineering 14
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 13C-Metabolic Flux Analysis of Human Monocytic Leukemia Cell Line THP-1 before and after Differentiation2021

    • Author(s)
      Mana Hontani, Nobuyuki Okahashi, Takeo Taniguchi, Fumio Matsuda
    • Organizer
      Metabolic engineering 14
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析を用いたマクロファージの分化による代謝変化の計測2021

    • Author(s)
      本谷真奈, 谷口赳夫, 岡橋伸幸, 松田史生
    • Organizer
      生物工学若手研究者の集い 夏のオンラインセミナー2021
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  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析法を用いた好中球の中心炭素代謝の解析2021

    • Author(s)
      岡橋伸幸, 谷口赳夫, 松田史生
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      第15回メタボロームシンポジウム
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  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析を用いたマクロファージの分化に伴う代謝変化の解析2021

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      本谷真奈, 谷口赳夫, 岡橋伸幸, 松田史生
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      第73回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析法を用いた好中球の中心炭素代謝の解析と機能制御のへの応用2021

    • Author(s)
      谷口赳夫, 岡橋伸幸, 松田史生
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      第73回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] 好中球の中心炭素代謝経路は活性酸素種産生能を制御する2021

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      谷口赳夫, 岡橋伸幸, 松田史生
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      第44回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析を用いたマクロファージへの分化に関与する中心炭素代謝経路の探索2021

    • Author(s)
      本谷真奈, 谷口赳夫, 岡橋伸幸, 松田史生
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      第44回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] 同位体標識を用いた代謝トレーシング解析のためのソフトウェア開発2021

    • Author(s)
      岡橋伸幸, 松田史生
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] 質量分析法を用いた骨髄性前駆細胞株HL-60の13C代謝フラックス解析2020

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      谷口赳夫 岡橋伸幸 松田史生
    • Organizer
      第68回質量分析総合討論会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析を用いた好中球における中心炭素代謝の測定2020

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      谷口赳夫 岡橋伸幸 松田史生
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      第2回生物工学若手会2020オンライン
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Measurement of neutrophils metabolism using 13C-metabolic flux analysis2020

    • Author(s)
      Takeo Taniguchi Nobuyuki Okahashi Fumio Matsuda
    • Organizer
      Metabolomics2020
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of a data processing platform for isotope tracing experiments in Garuda2020

    • Author(s)
      Nobuyuki Okahashi Fumio Matsuda
    • Organizer
      Metabolomics2020
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      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Clarificaion of relationship between neutrophils metabolism and differentiation/immuen function2020

    • Author(s)
      谷口赳夫 岡橋伸幸 松田史生
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
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      2020 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 同位体分布データ作成方法2021

    • Inventor(s)
      岡橋伸幸, 松田史生, 岡本真美, 山田洋平
    • Industrial Property Rights Holder
      岡橋伸幸, 松田史生, 岡本真美, 山田洋平
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2021-027052
    • Filing Date
      2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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