Development of automated methods for generating chemical reaction networks based on phase space geometry
Project/Area Number |
20K15224
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related
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Research Institution | Hokkaido University |
Principal Investigator |
水野 雄太 北海道大学, 電子科学研究所, 助教 (10846348)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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Keywords | 化学反応動力学 / 相空間幾何学 / 非統計的化学反応 / Lie正準変換摂動論 / Voronoi分割 / 教師あり主成分分析 / 第一原理分子動力学法 / 化学反応ダイナミクス / 化学反応ネットワーク |
Outline of Research at the Start |
化学反応経路図は,反応機構の解明や反応速度・選択性の予測に不可欠な学術的基盤である.しかし,従来の反応経路図の作成法には,化学反応における分子の運動の効果を考慮していないという問題点がある.そこで本研究では,分子の運動を幾何学的観点から捉える数学的理論である相空間幾何学に基づき,分子の運動の効果も考慮した反応経路図自動作成プログラムを開発する.これにより,実在の化学反応の動力学的反応機構の系統的解明と反応速度・選択性の系統的予測のための学術的基盤の構築を目指す.
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Outline of Annual Research Achievements |
本研究課題の目的は,動力学効果を考慮した反応経路図を相空間幾何学と第一原理分子動力学計算に基づき自動作成するプログラムを開発することである.化学反応動力学系の相空間は原子の位置と運動量を軸とする空間であり,分子の運動の様子は相空間内の軌道で表される.動力学効果が顕著な系では,同一の反応性をもつ複数の軌道が束状の構造(=動力学的反応経路)をなす.相空間の断面をとったとき,反応性軌道の束の断面はReactive Island (RI)とよばれる構造をなす.RIを計算することで,異なる動力学的反応経路の接続関係などの情報を得ることができる.昨年度出版したVoronoi分割を用いたRI計算法は,Voronoi分割によりRIの構造を近似し,その近似RIの境界上の点を初期値とする分子動力学計算により新たな軌道サンプルデータを追加していくことで,効率的にRI境界の近似精度を上げていく計算法である. Voronoi分割を用いたRI計算法をはじめとして,一般にRI構造の計算には次元の呪いの問題がある;大自由度系のRI構造は高次元構造であり,その計算には指数関数的な計算コストがかかる.実在の化学反応系は,いままで相空間幾何学が対象としてきたモデル系に比べると大自由度である.したがって,実在化学反応系の動力学的反応経路図の作成を目指す本研究においては,この次元の呪いの問題を解決する必要がある. そこで今年度は,この次元の呪いを解くために,大自由度系のRI構造の計算のための次元削減法を開発した.本手法では,(1)相空間の断面上で初期値をサンプリングして軌道計算を行い,(2)各初期値に対して軌道計算の結果から反応性のラベルをつけ,(3)この反応性ラベルを考慮して教師あり主成分分析により相空間断面の次元削減を行う.本手法の有効性を多自由度モデル系と実在化学反応系に適用し,有効性を確認した.
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
今年度は,教師あり主成分分析を用いた相空間構造解析のための次元削減法の開発に成功し,大自由度実在化学反応系に相空間幾何学を適用するときの課題の一つを(ある程度)解決できたと考えている.これは当初計画にはなかった成果である.一方で,本研究課題ではこれまで(1)Lie正準変換摂動論,(2)Voronoi分割を用いた相空間構造計算法,(3)教師あり主成分分析を用いた相空間構造解析のための次元削減法などを実装・開発してきたが,これらと(4)第一原理量子化学計算・分子動力学計算を組み合わせて実在化学反応系の動力学的反応経路図を作成するという最終目標については,いまだ本格的に取り組めていない.そのため,現在までの進捗状況は当初計画よりやや遅れていると自己判断した.
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Strategy for Future Research Activity |
本研究課題でこれまで実装・開発してきた(1)Lie正準変換摂動論,(2)Voronoi分割を用いた相空間構造計算法,(3)教師あり主成分分析を用いた相空間構造解析のための次元削減法に加えて,(4)第一原理量子化学計算・分子動力学計算を組み合わせて,実在化学反応系の動力学的反応経路図作成プログラムを完成させる.
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Report
(3 results)
Research Products
(8 results)