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Elucidation of mechanism regulating microenvironment within prokaryotic organella

Research Project

Project/Area Number 20K15430
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

Eguchi Yukako  金沢大学, ダイバーシティ推進機構, 特任助教 (60838506)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords原核細胞オルガネラ / オルガネラ内部環境 / 磁性細菌 / バイオミネラリゼーション / オルガネラ内部環境制御
Outline of Research at the Start

オルガネラの内部環境は、その機能発現のために精密に制御されている。磁性細菌は膜小胞の中に磁鉄鉱結晶を生合成することで、地磁気を感知するための原核細胞オルガネラ「マグネトソーム」を形成するが、その内部環境の制御機構は未解明である。本研究ではマグネトソーム内部のpHの制御機構に焦点をあて、pHの制御への関与が期待される輸送体蛋白質およびマグネトソーム表面蛋白質の機能を解析する。本研究により、磁性細菌のマグネトソーム内部のpHがどのように制御され、pHの制御が磁鉄鉱の生合成にどのように寄与するかを明らかにし、マグネトソームの内部環境制御機構の一端を解明する。

Outline of Final Research Achievements

Magnetotactic bacteria form prokaryotic organelles called “magnetosomes”, which function as magnetic compasses. The formation of magnetosomes is accomplished by the synthesis of magnetite nanocrystals within magnetosome vesicles. However, the mechanism of regulating the microenvironment within magnetosome vesicles during synthesis of magnetite crystals remains elusive. In this study, the basis for pH measurement and observation of ferric ion dynamics under the lack of proteins considered to be involved in pH regulation was constructed. This research will lead to the establishment of methods for analyzing redox potential and other biomolecular dynamics.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

オルガネラの内部環境の制御に関しては、真核細胞ではよく研究されているが、原核細胞オルガネラの内外の環境制御の研究については今後の展開が待たれる。本研究において、原核細胞オルガネラにおけるpH測定や鉄動態の観察に向けた基盤を構築した。この基盤により、その他の環境因子のイメージング技術の確立や、磁性細菌以外の細菌の持つオルガネラにおける環境制御のメカニズムの解析にも応用の可能性が広がる。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Influence of protozoan grazing on magnetotactic bacteria on intracellular and extracellular iron content2023

    • Author(s)
      Seki Yusuke、Eguchi Yukako、Taoka Azuma
    • Journal Title

      Environmental Microbiology Reports

      Volume: 15 Issue: 3 Pages: 181-187

    • DOI

      10.1111/1758-2229.13140

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent advances in studies on magnetosome‐associated proteins composing the bacterial geomagnetic sensor organelle2023

    • Author(s)
      Taoka Azuma、Eguchi Yukako、Shimoshige Rino、Fukumori Yoshihiro
    • Journal Title

      Microbiology and Immunology

      Volume: 67 Issue: 5 Pages: 228-238

    • DOI

      10.1111/1348-0421.13062

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Live-Cell Fluorescence Imaging of Magnetosome Organelle for Magnetotaxis Motility2023

    • Author(s)
      Eguchi Yukako、Taoka Azuma
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2646 Pages: 133-146

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3060-0_12

    • ISBN
      9781071630594, 9781071630600
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] NanoBRET法を用いたマグネトソームタンパク質間相互作用の検出法の開発2022

    • Author(s)
      菊池 咲紀, 江口 友佳子, 田岡 東
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 細菌オルガネラ「マグネトソーム」の形成初期に起こるタンパク質間相互作用の同定2022

    • Author(s)
      古田 瑞希, 江口 友佳子, 田岡 東
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Identification of protozoan predators that feed on magnetotactic bacteria from freshwater environment.2022

    • Author(s)
      Yukako Eguchi, Yusuke Seki, Yoshinobu Ikeda, Yoshihiro Fukumori, Azuma Taoka
    • Organizer
      The 7th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Qind株を用いた細胞内で新規合成されたマグネトソーム配置機構解析2022

    • Author(s)
      下茂 梨乃, 江口 友佳子, 田岡 東
    • Organizer
      第18回 21世紀大腸菌研究会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Imaging of amphitrichous flagellar rotations in Magnetospirillum magneticum AMB-12021

    • Author(s)
      江口 友佳子、高岡 祐太、川村 想、福森 義宏、田岡 東
    • Organizer
      第94回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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