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Identification of QTLs involved in root thickness in the wild sweetpotato

Research Project

Project/Area Number 20K15505
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
Research InstitutionNational Agriculture and Food Research Organization

Principal Investigator

Suematsu Keisuke  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 研究員 (30807996)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsサツマイモ / Ipomoea trifida / 根の肥大性 / QTL / 塊根形成 / サツマイモ野生種 / 根の肥大
Outline of Research at the Start

サツマイモの近縁野生種であるIpomoea trifidaは、一般的に塊根を形成しないことが知られているが、塊根様の太い根を形成する系統が見出された。本研究では、この根が肥大する特徴的なI. trifidaを用いて、根の肥大に関わるQTLを明らかにするとともに、サツマイモにおける塊根形成能との関連について研究を進める。

Outline of Final Research Achievements

Ipomoea trifida, the closest relative of sweetpotato, does not generally form storage roots, but some lines develop thick roots. In this study, QTL (qRT1) involved in the root thickness was identified using QTL-seq. Moreover, the candidate gene for ItRT1 was identified from genes on the structural variant located in qRT1. The sweetpotato homolog of ItRT1, IbRT1, was specifically expressed in pencil roots and storage roots. Therefore, the results of this study suggest ItRT1 and IbRT1 are related to root development in I. trifida and sweetpotato.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

サツマイモは野生種から進化の過程で根の肥大性を獲得したと考えられるものの、どのような変異の集積により塊根を形成するようになったのか、その遺伝学的背景は不明な点が多い。本研究で発見されたQTLおよびその候補遺伝子は、サツマイモ塊根の進化に関与することが示唆されており、この謎を解明する鍵となることが期待される。さらに、本遺伝子を足掛かりにサツマイモにおける塊根形成メカニズムの解明が進むものと考えられる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Identification of a major QTL for root thickness in diploid wild sweetpotato (<i>Ipomoea trifida</i>) using QTL-seq2021

    • Author(s)
      Suematsu Keisuke、Tanaka Masaru、Isobe Sachiko
    • Journal Title

      Plant Production Science

      Volume: 25 Issue: 1 Pages: 120-129

    • DOI

      10.1080/1343943x.2021.1927766

    • NAID

      130008005895

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] サツマイモ塊根の進化に関わる根の肥大遺伝子の推定2023

    • Author(s)
      末松恵祐、田中勝
    • Organizer
      日本育種学会第143回講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] BSAおよびGWASによる6倍体サツマイモの巻つる性に関する遺伝子座の特定2022

    • Author(s)
      末松恵祐
    • Organizer
      日本育種学会第141回講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] QTL-seqによるサツマイモ二倍体野生種Ipomoea trifidaにおける根の肥大性に関与する遺伝領域の特定2021

    • Author(s)
      末松恵祐・田中勝・磯部祥子
    • Organizer
      日本作物学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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