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ロタウイルスの種間伝播動態の解明と農場への病原体侵入リスク指標への応用

Research Project

Project/Area Number 20K15663
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases (2022-2023)
Gifu University (2020-2021)

Principal Investigator

西山 祥子  国立感染症研究所, ウイルス第一部, 主任研究官 (90817058)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords野生動物 / ロタウイルス / 節足動物媒介感染症 / 野生動物媒介感染症 / 家畜 / 次世代シークエンスを用いた網羅的解析 / Torque teno virus / ダニ媒介性脳炎ウイルス / 種間伝播 / 家畜衛生 / 疫学 / 数理モデル
Outline of Research at the Start

近年、日本では野生動物由来感染症の農場汚染が大きな社会問題となっている。そのため、農場への病原体侵入のリスク評価が重要であり、このための指標が必要とされる。この指標因子として、ロタウイルスを提案したい。ロタウイルスは宿主域が広く、自然界に広く蔓延している。多くの種間伝播の報告もある。このため、家畜、野生動物由来ロタウイルスの遺伝子を時系列的に解析することにより、家畜と接触した野生動物の特定、家畜と野生動物でのウイルス伝播の方向性を推定することが可能となる。本研究では野生動物と家畜のロタウイルス遺伝子を基に種間伝播の動態を網羅的に解析し、農場の防疫強化に向けた新規知見を得ることを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では野生動物や家畜が保有するロタウイルスや各種ウイルスの遺伝子を解析することにより、野生動物が運ぶ感染症の流行を予測することである。
今年度は引き続き野生動物の糞便、血液、及び体に付着しているマダニの収集を行った。また、糞便サンプルを解析する際に偶発的に認められた犬科動物由来Torque teno virus(TTV) についてウイルス遺伝子解析を行った。その結果、2種類のたぬき由来のTTVと1種類のキツネ由来のTTVが新種であると明らかとなった。犬科またその遺伝情報をGene bankに登録した。さらにこれらの結果を既知の犬科由来のTTV遺伝子と比較解析したところ、Thetatorquevirus, Upsilontorquevirusに加えてもう一つの未分類のクラスターがあることが明らかになった。現在、これらの結果を論文に投稿する予定である。
また、野生動物が付着しているマダニが保有するウイルスを解析した。シカからフタトゲチマダニ(オス、成ダニ)32匹、フタトゲチマダニ(メス、成ダニ)10匹、フタトゲチマダニ(メス、若ダニ)15匹、キチマダニ(オス、幼ダニ)22匹、オオトゲチマダニ(オス、成ダニ)18匹を採取した。それらの乳剤を作製し、マダニ(Ixodes scapularis)由来の培養細胞であるISE6細胞に接種し、3回継代した。継代後の培養細胞上清からRNAを抽出し、次世代シークエンスにて解析を行った。しかし、ウイルスは検出されなかった。今後はサンプル数を増やして更なる解析を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

ウイルスの検出率が想定より低かった。このことからサンプル数を不十分であった可能性が考えられる。

Strategy for Future Research Activity

ウイルスの検出数を上げるために、解析するサンプル数を増やす必要がある。そのため、岐阜へのサンプル採集頻度を増加させる。また、関東周辺でのサンプル収集も行う予定である。

Report

(4 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-12-25  

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