| Project/Area Number |
20K15674
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
|
|---|
| Research Institution | Hokkaido University (2020-2021, 2023)
Rakuno Gakuen University (2022) |
|---|
Principal Investigator |
Ohari Yuma 北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 助教 (00847056)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
|
| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
|
|---|
| Keywords | フタトゲチマダニ / ミトゲノム / ゲノムワイドSNP / 集団構造 / オオトゲチマダニ / 一塩基多型 / 集団遺伝学 / 集団遺伝 / MIG-seq / SNP / 分子系統学的解析 / 集団遺伝学的解析 / ヤマトチマダニ / マイクロサテライト |
|---|
| Outline of Research at the Start |
マダニ類の分布拡大プロセスを推定することは疫学上重要である。分布拡大プロセスの推定には、遺伝的に近縁な個体の集まり（集団）や、集団間の分断や連結性などの集団構造を解析する必要があるため、本研究では、生息環境や繁殖形態がフタトゲチマダニの集団構造に与える影響を解析し、分布拡大プロセス推定における集団構造のスタンダードモデルを提唱することを目的とする。本研究の結果から、本種の分布拡大プロセスの推定が可能となり、TBDの効率的な防除対策に貢献することが可能となる。さらに本研究で提唱されるモデルは、他のマダニ類の分布拡大の解析や予想にも応用できる。
|
| Outline of Final Research Achievements |
The genetic characteristics based on the mitochondrial genome (mitogenome) and genome-wide SNPs were compared among populations of Haemaphysalis longicornis to elucidate the influence of habitat and reproductive phenotypes. The ticks collected from the natural environment in Japan and Oceania, as well as some laboratory-maintained strains with known reproductive phenotypes, were employed in these analyses. The population separation between Japan and Oceania was clearly demonstrated baed on the population genetic analyses using SNPs. Furthermore, there was no genetic segregation between reproductive phenotypes based on either genetic levels. These findings suggest that the population structure of Haemaphysalis longicornis in Japan is homogeneous among localities.
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
フタトゲチマダニはウイルスなどの病原体を媒介するため、公衆衛生上の観点からその分布の大きさや移動経路について明らかにする必要がある。本研究ではこれまで実施されていた解析に加えて、より詳細な解析が可能な手法を用いて個体群間の遺伝的関係を調べた。その結果、これまでの手法では識別できなかった個体群を識別できすることができ、日本とオセアニア諸国の間で遺伝的違いが見られた。
|
