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microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding

Research Project

Project/Area Number 20K15709
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionOkinawa Institute of Science and Technology Graduate University

Principal Investigator

Sako Hiroaki  沖縄科学技術大学院大学, 細胞シグナルユニット, ポストドクトラルスカラー (80793570)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords翻訳速度 / リボソームプロファイリング / 新生鎖 / タンパク質変性 / 糖尿病 / miRNA / インスリン
Outline of Research at the Start

タンパク質の変性は,アルツハイマー型認知症などに加え,II型糖尿病や動脈硬化症や老化など,50以上の疾病や病態にも関連すると考えられている.
これまでの研究では,主に成熟したタンパク質の変性が着目されてきた.しかし実際は,生まれたばかりの新生タンパク質もすでに変性していることが分かってきた.つまり数々の疾病に関連するタンパク質の変性を回避するためには,なぜ新生タンパク質がすでに変性しているのか,そして細胞内のどのようなメカニズムが新生タンパク質の変性を制御しているのかを解明する必要がある.
本研究では,何が新生タンパク質の変性を特異的に制御しているのかを解明し応用することを目的としている.

Outline of Final Research Achievements

A combined analysis of ribosome profiling and miRNA-binding sites revealed that CDS-targeting miRNAs can slow translating ribosomes without suppressing translational elongation. To further understand the notion in an experimentally, a reporter was designed to examine the folding status of nascent proteins which may be mediated by CDS-targeting miRNAs.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

miRNAは標的mRNAに結合し、mRNAの分解や翻訳抑制を亢進することが広く知られている。miRNAはmRNAのCDSへも3´UTRと同程度結合するが、CDSに結合するmiRNAの発現量への影響は小さく、なぜ多くのmiRNAがCDSにも結合するのかは分かっていなかった。本研究では、一部のmiRNAは、標的のmRNA分解や翻訳抑制ではなく、リボソームの翻訳速度を局所的に遅くすることで、新たに生まれたタンパク質の折り畳みを促進していることを示すとともに、様々な疾患と関連するタンパク質変性の抑止策の一つとして新たな可能性を示すことができた。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding in eukaryotes2023

    • Author(s)
      Sako Hiroaki、Youssef Mohieldin、Elisseeva Olga、Akimoto Takayuki、Suzuki Katsuhiko、Ushida Takashi、Yamamoto Tadashi
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 42 Issue: 18

    • DOI

      10.15252/embj.2022112469

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2020

    • Author(s)
      Sako Hiroaki、Akimoto Takayuki、Suzuki Katsuhiko、Ushida Takashi、Yamamoto Tadashi
    • Journal Title

      biRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2020.12.08.417139

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Open Access
  • [Presentation] microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2023

    • Author(s)
      Hiroaki Sako, Tadashi Yamamoto
    • Organizer
      System Biology seminar
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2023

    • Author(s)
      Hiroaki Sako, Tadashi Yamamoto
    • Organizer
      OIST-RIKEN meeting
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2023

    • Author(s)
      Hiroaki Sako, Tadashi Yamamoto
    • Organizer
      Signal Network Meeting
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] microRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2023

    • Author(s)
      Hiroaki Sako, Tadashi Yamamoto
    • Organizer
      OIST-Kyudai Joint Symposium Series 1: Bio-Inspired Wonders and Energy Innovations
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] miRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2022

    • Author(s)
      佐古博皓
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] miRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding2022

    • Author(s)
      佐古博皓
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] miRNAs slow translating ribosomes to prevent protein misfolding in a CCR4-NOT-dependent manner2021

    • Author(s)
      佐古博皓
    • Organizer
      CCR4-NOT研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ポリペプチド翻訳遅延剤2020

    • Inventor(s)
      Sako,Ushida,Akimoto,Suzuki
    • Industrial Property Rights Holder
      Sako,Ushida,Akimoto,Suzuki
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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