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Elucidation of recognition and regulation of chromatin by innate immune DNA sensor cGAS

Research Project

Project/Area Number 20K15711
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Kujirai Tomoya  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (70823566)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywordsクロマチン / cGAS / ヌクレオソーム / 自然免疫 / DNAセンサー / ゲノムDNA
Outline of Research at the Start

生物は、ウイルスなどの微生物に対する防衛策として外来DNAを検知する自然免疫を備えている。自然免疫におけるDNAセンサーは、外来(非自己)DNAと、自己のゲノムDNAを厳密に区別しなければならないが、その機構は不明である。本研究では、自然免疫DNAセンサーが、ゲノムDNAの実態であるクロマチンと相互作用する機構を構造生物学的、生化学的解析により解明する。これにより、ゲノムDNAを自己のDNAとして認識するメカニズムの解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Vertebrates have an innate immune DNA sensor cGAS to defend against foreign DNA such as viruses. On the other hand, cells have their own genomic DNA, and therefore cGAS must be inactivated against DNA that has formed chromatin. We have determined the three-dimensional structure of cGAS in complex with the nucleosome, the basic unit of chromatin, by cryo-EM analysis. Our results elucidate the mechanism of cGAS inactivation by nucleosomes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で明らかになったcGASの制御機構は、自己と非自己のDNAの区別という、自然免疫分野における中心的な問に一つの答えを与えるものであると考えられる。また、cGASは、がん、老化、自己免疫疾患などの広範な疾病に関与している。本研究成果は、これらの疾病の発症のメカニズムや、制御法についての重要な知見を与えると期待される。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] The Rockefeller University(米国)

    • Related Report
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  • [Journal Article] クロマチンを形成したゲノムDNAが自然免疫DNAセンサーcGASの監視から逃れる仕組み2021

    • Author(s)
      鯨井 智也、胡桃坂 仁志
    • Journal Title

      臨床免疫・アレルギー科

      Volume: 75 Pages: 722-729

    • NAID

      40022604517

    • Related Report
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  • [Journal Article] Inactivation Mechanism of an Innate Immune DNA Sensor cGAS by Self-chromatinized DNA2021

    • Author(s)
      鯨井 智也、胡桃坂 仁志
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 61 Issue: 5 Pages: 324-326

    • DOI

      10.2142/biophys.61.324

    • NAID

      130008093151

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • Related Report
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  • [Journal Article] Contributions of Histone Variants in Nucleosome Structure and Function2021

    • Author(s)
      Kurumizaka Hitoshi、Kujirai Tomoya、Takizawa Yoshimasa
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 433 Issue: 6 Pages: 166678-166678

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.10.012

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural basis for the inhibition of cGAS by nucleosomes2020

    • Author(s)
      Kujirai Tomoya、Zierhut Christian、Takizawa Yoshimasa、Kim Ryan、Negishi Lumi、Uruma Nobuki、Hirai Seiya、Funabiki Hironori、Kurumizaka Hitoshi
    • Journal Title

      Science

      Volume: 370 Issue: 6515 Pages: 455-458

    • DOI

      10.1126/science.abd0237

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Cryo-EM structure of cGAS-nucleosome reveals the mechanism of innate immune inhibition2022

    • Author(s)
      Tomoa Kujirai
    • Organizer
      44th Indian Biophysical Society Meeting
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] cGAS-ヌクレオソーム複合体構造から明らかになった自然免疫の不活化機構2021

    • Author(s)
      鯨井智也, 滝沢由政, 根岸瑠美, 粉間信樹, 平井誠也, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      日本遺伝学会第93回大会
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    • Invited
  • [Presentation] 自然免疫DNAセンサーcGASとヌクレオソーム複合体のクライオEM構造解析2021

    • Author(s)
      鯨井智也, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 第77回学術講演会
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    • Invited
  • [Presentation] ヌクレオソームによる自然免疫DNAセンサーcGASの不活性化機構2021

    • Author(s)
      鯨井智也, Christian Zierhut, 滝沢由政, Ryan Kim, 根岸瑠美, 粉間信樹, 平井誠也, 船引宏則, 胡桃坂 仁志
    • Organizer
      第38回 染色体ワークショップ 第19回核ダイナミクス研究会
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  • [Presentation] cGAS-ヌクレオソーム複合体構造から明らかになったヌクレオソームによるcGAS不活性化のメカニズム2020

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      鯨井智也, Christian Zierhut, 滝沢由政, Ryan Kim, 根岸瑠美, 粉間信樹, 平井誠也, 船引宏則, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡解析から明らかになったヌクレオソームDNA転写のダイナミクス2020

    • Author(s)
      鯨井智也
    • Organizer
      令和2年度第2回量子線科学セミナー
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      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] 自然免疫の外来DNAセンサーcGASが自己の染色体DNAに反応しないメカニズムを解明

    • URL

      https://www.amed.go.jp/news/release_20200911-02.html

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  • [Remarks] 自然免疫の外来DNAセンサーcGASが自己の染色体DNAに反応しないメカニズムを解明

    • URL

      https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/press/z0207_00033.html

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  • [Remarks] 自然免疫の外来DNAセンサーcGASが自己の染色体DNAに反応しないメカニズムを解明

    • URL

      http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/press_release/200911/

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      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2023-01-30  

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