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Mechanisms of transcriptional activation via RNA Cloud formed by ELEANOR noncoding RNAs

Research Project

Project/Area Number 20K15722
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionJapanese Foundation for Cancer Research

Principal Investigator

ICHIKAWA Yuichi  公益財団法人がん研究会, がん研究所 がん生物部, 研究員 (20632160)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsエピジェネティクス / クロマチン / ノンコーディングRNA / ER陽性乳がん / スーパーエンハンサー / ELEANOR / ESR1 / ChIRP / non-coding RNA
Outline of Research at the Start

遺伝子の発現を制御する因子として、タンパク質へ翻訳されずに細胞核内で機能するノンコーディングRNAが注目を集めている。本研究は、ER陽性乳がんで高発現しており、がん化や治療耐性化に関与する核内長鎖ノンコーディングRNA「エレノア」の機能解析を行う。エレノアは、クロマチンを取り囲むように集合し、その近傍の遺伝子の転写を活性化することが報告されている。しかし、RNAが集合する機構や転写活性化の詳しいメカニズムは明らかになっていない。本研究では、液-液相分離の観点から研究を行い、この分子基盤の解明を目指す。得られる成果は、がんの診断や治療標的の同定につながると期待される。

Outline of Final Research Achievements

ELEANORS, a cluster of long noncoding RNAs, are thought to be involved in the recurrence of ER-positive breast cancer by forming an RNA cloud and activating transcription of the ESR1 gene, which encodes the estrogen receptor (ER). In this study, we have revealed that ELEANORS are associated with super-enhancer near the ESR1 gene and promote BRD4 recruitment. We have also showed that BRD4 is required for transcription of the ELENAORS and growth of ER-positive breast cancer cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

エレノアRNAは細胞のがん化や乳がんの治療耐性化との関与が示唆されている。したがって、本研究によって得られた成果は、がん細胞が治療抵抗性を獲得するメカニズムの一端を明らかにするものであり、再発がんの診断あるいは新たな治療標的の同定につながると期待される。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] The ELEANOR non‐coding RNA expression contributes to cancer dormancy and predicts late recurrence of ER‐positive breast cancer2022

    • Author(s)
      Fukuoka Megumi、Ichikawa Yuichi、Osako Tomo、Fujita Tomoko、Baba Satoko、Takeuchi Kengo、Tsunoda Nobuyuki、Ebata Tomoki、Ueno Takayuki、Ohno Shinji、Saitoh Noriko
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: - Issue: 7 Pages: 2336-235

    • DOI

      10.1111/cas.15373

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Shaping of genome by long noncoding RNAs2021

    • Author(s)
      Ichikawa Yuichi、Saitoh Noriko
    • Journal Title

      Cytogenomics

      Volume: - Pages: 357-372

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-823579-9.00018-7

    • ISBN
      9780128235799
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 非コードRNAエレノアとクロマチンの相互作用を介したESR1遺伝子の転写活性化2021

    • Author(s)
      市川雄一, 斉藤典子
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ER陽性乳がん細胞で発現する長鎖非コードRNA ELEANOR2はRNAクラウドを形成し転写を促進する2021

    • Author(s)
      市川雄一, 斉藤典子
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Discovery of novel RNA clouds in ER-positive breast cancer cells2020

    • Author(s)
      市川雄一、斉藤典子
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2023-01-30  

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