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Analysis of the integration mechanism of light and the circadian clock signals in the basal land plant Marchantia polymorpha

Research Project

Project/Area Number 20K15818
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Inoue Keisuke  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (20805931)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords光 / 概日時計 / 光周性 / 成長相転換 / 基部陸上植物 / ゼニゴケ / 光受容体 / 日長 / 光シグナル / 日長認識
Outline of Research at the Start

日長を認識した季節応答は、生物が適切なタイミングで繁殖する仕組みとして重要である。被子植物の日長認識機構は、光シグナルと概日時計の相互作用によって成立する。日長要求性の違いによって相互作用の仕組みが異なることから、個々の植物種がそれぞれに適した日長認識機構を進化させたことが予想されるが、これまでの日長認識機構の解析は被子植物に限定されており、進化的な考察が不十分であった。本研究では、基部陸上植物である苔類ゼニゴケの日長認識機構を、生理学・生化学・分子遺伝学的な手法によって多角的に解析し、日長認識の基本メカニズムを分子レベルで解明することで、陸上植物の日長認識機構の普遍性と多様性を理解する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we examined the mechanism for day-length perception in the basal land plant, the liverwort Marchantia polymorpha. We observed growth phase transitions under various diel conditions other than 24 hours (so-called T-cycles and NH-cycles), and found that the growth phase transition in M. polymorpha is generally determined by the ratio of the length of the light and dark periods. In addition, we confirmed that disturbance of endogenous rhythms by disruption of clock genes via CRISPR/Cas9-mediated genome editing or pharmacological analysis did not significantly affect growth phase transitions. Furthermore, we identified a set of genes, whose expression is dramatically induced in response to the length of the light period and found that there are various kinds of phytohormone biosynthetic genes. These results suggest that, unlike angiosperms, the basal land plant M. polymorpha has a day-length perception mechanism that is largely independent of the circadian clock.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

日長を認識して応答を制御する「光周性」は概日時計と光シグナルの相互作用を介した外的符号モデルによって制御されることが知られていたが、光周性研究は被子植物に限定されていたため、幅広い植物種にも外的符号モデルが成り立つのかは未明であった。本研究ではゼニゴケの日長応答が概日時計に大きく依存せず、明期と暗期の長さの比によって決まることを明らかにし、基部陸上植物が被子植物とは異なる日長認識機構を持つこと明らかにした。これまでは限られた植物種の解析によって日長認識機構のモデルが提唱されてきたが、本研究の成果は植物が多様な日長認識機構をもつ可能性を示しており、研究分野に新たな視点をもたらすと考えられる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] A guiding role of the Arabidopsis circadian clock in cell differentiation revealed by time-series single-cell RNA sequencing2022

    • Author(s)
      Torii Kotaro、Inoue Keisuke、Bekki Keita、Haraguchi Kazuya、Kubo Minoru、Kondo Yuki、Suzuki Takamasa、Kubota Akane、Uemoto Kyohei、Shimizu Hanako、Saito Masato、Fukuda Hiroo、Araki Takashi、Endo Motomu
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 40 Issue: 2 Pages: 111059-111059

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111059

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Regulation of gametangia and gametangiophore initiation in the liverwort Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Yamaoka Shohei、Inoue Keisuke、Araki Takashi
    • Journal Title

      Plant Reproduction

      Volume: 34 Issue: 4 Pages: 297-306

    • DOI

      10.1007/s00497-021-00419-y

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ゼニゴケにおける日長に応答した生殖成長移行のmiR529c-SPL2モジュールによる制御機構の解析2023

    • Author(s)
      穴田 小恵、冨田 由妃、井上 佳祐、山岡 尚平、荒木 崇
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおける精細胞特異的なRNA制御機構2022

    • Author(s)
      井上 佳祐, 小谷 莞太, 真柴 誠, 穴田 小恵, 肥後 あすか, 山岡 尚平, 荒木 崇
    • Organizer
      第10回植物RNA研究ネットワークシンポジウム「RNA から植物を考える」
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼニゴケの生活環において多面的に機能する転写因子MpLRLの発現解析2022

    • Author(s)
      樅木 亮介、齊藤 美咲、吉竹 良洋、井上 佳祐、河内 孝之、荒木 崇、山岡 尚平
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼニゴケの生活環におけるMpMS1の機能解析2022

    • Author(s)
      三枝 菜摘、國本 完、肥後 あすか、神原 泉、冨田 由妃、井上 佳祐、山岡 尚平、荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼニゴケにおける無性芽器形成と有性生殖誘導の関係2022

    • Author(s)
      利光 珠実、井上 佳祐、山岡 尚平、荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular mechanism for far-red light- and photoperiod-dependent growth phase transition in Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      金坂侑紀、井上佳祐、山岡尚平、荒木崇
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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