• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Observation of transcription activity during the process of heat stress memory establishment

Research Project

Project/Area Number 20K15836
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 44040:Morphology and anatomical structure-related
Research InstitutionYamagata University (2021-2022)
The University of Tokyo (2020)

Principal Investigator

Shibuta K. Mio  山形大学, 理学部, 助教 (30849790)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywordsイメージング / 熱ストレス / 翻訳後修飾 / RNAポリメラーゼII / 核構造 / クロマチンダイナミクス / 転写制御 / シロイヌナズナ / ライブイメージング / 画像解析 / ストレス応答 / エピジェネティック修飾 / 核 / 熱記憶 / RNAポリメラーゼ II / 核内構造 / 高温応答
Outline of Research at the Start

植物は過去の高温ストレスを記憶し、次回ストレスに晒された際により効率的に応答することができる。「記憶」の構築には、エピジェネティック修飾制御が重要な役割を持つことが明らかにされたが、その過程における遺伝子配置ダイナミクスについての核内形態および構造学的な研究は技術的な問題から未だ不十分である。本研究では蛍光イメージングを主な解析手法とし、翻訳後修飾のライブイメージングツールやシングルコピー遺伝子の可視化法を取り入れることで核内転写活性環境フレームワークの構築メカニズムの解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Plants can make memory once they experience high temperature, and that memory allows them to cope with similar stress more efficiently. It is difficult to study chromatin dynamics and epigenetic regulation during establishment of the memory due to technical challenges. In this study, I introduced a live imaging method for observing post-translational modification in Arabidopsis thaliana, and attempted to elucidate the transcription regulation mechanism from the perspective of chromatin structure. I developed a live imaging method to monitor the transcription activity focusing on dynamics of RNA polymerase II, and I have submitted the results to several journals. In addition, NGS analysis suggested that post-translational modifications of RNA polymerase II are involved in the regulation of in the rapid heat stress response. I will continue to investigate the transcription regulation mechanism, with a specific focus on the nuclear dynamics of RNA polymerase II.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で構築した転写活性レベルイメージングシステムは植物にとどまらず様々な真核生物に応用可能であり、ストレス応答、発生・再生といった生命現象の研究や翻訳後修飾ダイナミクスに着目した創薬開発の促進に貢献できると考えられる。また転写活性領域制御への関与が示唆されたRNAポリメラーゼII-C末端領域修飾による転写制御と、知見の豊富な転写因子による転写制御とのクロストークの解析を進めることで、多層的で緻密な転写制御機構の解明が期待できる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A live imaging system to analyze spatiotemporal dynamics of RNA polymerase II modification in Arabidopsis thaliana2021

    • Author(s)
      M. Shibuta, T. Sakamoto, T. Yamaoka, M. Yoshikawa, S. Kasamatsu, N. Yagi, S. Fujimoto, T. Suzuki, S. Uchino, Y. Sato. H. Kimura, and S. Matsunaga
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: 580-580

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02106-0

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] RNAポリメラーゼII-C末端ドメイン修飾酵素過剰発現細胞における転写活性領域の観察2023

    • Author(s)
      澁田未央
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAポリメラーゼII-C末端ドメイン脱リン酸化酵素による転写活性領域制御機構の解明2022

    • Author(s)
      澁田未央
    • Organizer
      東北植物学会第12回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるヒストン修飾H3K4me3のライブイメージング解析2022

    • Author(s)
      松岡慈、坂本卓也、澁田未央、佐藤優子、木村宏、松永幸大
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAポリメラーゼII-CTD修飾の核内分布の観察2021

    • Author(s)
      澁田未央,坂本卓也,松永幸大
    • Organizer
      日本植物形態学会第33回総会・大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] RNAポリメラーゼII-CTD修飾の核内分布から転写活性の高い核内領域を読み解く2021

    • Author(s)
      澁田未央,坂本卓也,松永幸大
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ヒストン修飾およびPolII-CTD修飾のイメージングと画像解析から時空間的転写ステータスを読み解く2021

    • Author(s)
      澁田未央,松岡慈、坂本卓也,松永幸大
    • Organizer
      東北植物学会第11回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ヒストン修飾や RNA ポリメラーゼ II 修飾のライブイメージングシステムの構築2021

    • Author(s)
      澁田未央 、吉川真由、山岡珠子、坂本卓也 、木村宏 、松永幸大
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] RNA ポリメラーゼ II セリン2リン酸化のライブイメージングシステムの構築2020

    • Author(s)
      澁田未央 、吉川真由、山岡珠子、坂本卓也 、木村宏 、松永幸大
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] 細胞内抗体プローブを用いて 遺伝子の転写が活性化している細胞を生体内で特定することに成功

    • URL

      https://www.yamagata-u.ac.jp/jp/information/press/20210518_01/

    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi