結核患者のクラスター形成に関与する宿主遺伝因子の探索
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20K15847
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 45010:Genetics-related
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases (2021-2022)
National Center for Global Health and Medicine (2020) |
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Principal Investigator |
宮原 麗子 国立感染症研究所, 感染症疫学センター, 室長 (40567301)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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| Keywords | 結核 / 全ゲノム解析 / クラスター / 感染症 / 結核菌 / 感染伝播 / 遺伝子解析 / 結核感染症 / 東南アジア / 宿主遺伝子 / ゲノム解析 |
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| Outline of Research at the Start |
結核感染症は今なお世界の３大感染症の一つであり、感染拡大予防の新たな対策が必要である。本研究の目的は、結核患者と結核菌のゲノム情報を用いて集団発生に寄与する早期発病患者の宿主遺伝要因を明らかにすることである。結核菌の全ゲノム解析によって特定されたクラスター群に含まれる患者に対してインタビュー調査を行い、感染経路や感染時期を推定し、クラスター群内の疫学的な繋がりを明らかにする。またクラスターを形成する結核患者は最近の感染伝播によって発病した可能性が高いため、クラスター群と非クラスター群でGWASとHLA比較解析を実施することで、クラスター形成や早期発症に関与する宿主遺伝要因の探索を行う。
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| Outline of Annual Research Achievements |
結核感染症は世界３大感染症の一つであり、アフリカや東南アジア諸国など低中所得国の感染者数や死亡者数が大多数を占めている。これまでの研究で、結核菌遺伝子型による感染流行地域の違いやクラスターを形成しやすい感染者の特徴に違いがあることが示されているが、本研究の目的は、こうした感染伝播の不均一さを生み出す要因を、集団の特徴や接触パターンから明らかにすることである。本研究は2017年から2020年にかけてタイ北部チェンライ県で結核と診断された患者を対象に実施し、疫学情報の収集と、患者の喀痰培養検体からDNAを抽出し全ゲノム解析を実施した。また、結核感染者の接触者の調査を行い、インターフェロンγ遊離試験（IGRA検査）を用いて、患者の接触者(主に家族内接触者）の潜在性結核感染率を調査した。全ゲノム解析の結果から遺伝子クラスターを同定したところ、過去に服役した経歴を持つ患者が感染拡大と関連していることが判明した。クラスターに含まれる元受刑者の居住地はさまざまであり、地域内で感染し発症したのではなく、刑務所内での感染曝露を経て、出所後発症した可能性が示唆された。感染拡大のリスクがある患者を特定することによって、重点的な介入対象者の選定や効果的な感染対策や結核スクリーニング手法の提案ができると考える。また、接触者調査の結果、家族内接触者のIGRA陽性(潜在性結核)率は、結核菌遺伝子型（Lineage2）と関連しており、Lineage2が感染伝播しやすいというこれまでの報告と一致する結果であった。Lineage別に発症リスクや感染拡大リスクを検討することの重要性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定していた検体とデータ収集は終了しており、現在解析と論文執筆をしている。本研究課題の成果の一部は国際学術誌に論文発表され、国際学会で発表した。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、収集したデータを解析し論文を執筆する予定である。また、研究協力者に研究成果を報告し、本研究成果をもとにした新たな研究計画を立案する方針である。
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Report
(3 results)
Research Products
(4 results)
