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New evolutionary model based on evolutionary developmental studies of hatching gland cells

Research Project

Project/Area Number 20K15850
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 45020:Evolutionary biology-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

Nagasawa Tatsuki  東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (60782828)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords魚類 / 両生類 / 卵保護 / 繁殖戦略 / 孵化 / 卵膜 / 孵化酵素 / 孵化腺細胞 / ゼブラフィッシュ / 真骨魚類 / ノックアウト / Evo-devo / ツメガエル / 胚葉 / NGS解析 / ゲノム編集 / 転写因子
Outline of Research at the Start

申請者がこれまでに作出した孵化腺細胞欠失ゼブラフィッシュ系統を用い、その原因遺伝子を中心とした孵化腺細胞分化カスケードを明らかにし、これを進化的に比較することで孵化腺細胞の転移機構を解明することが本研究の目的となる。そのために、NGS解析を中心とした解析を計画している。さらにこれを可能とする為の新たな変異系統を、ゲノム編集と交配によって作出する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we focused on the evolution of hatching enzymes, which are essential for the hatching of oviparous vertebrates, and their producing cells, hatching gland cells. Our results comprehensively elucidate the molecular evolution of the astacin family, including hatching enzymes, across vertebrates. Additionally, we identified the genes associated with egg protection in fish and elucidated their evolutionary patterns, thereby linking the evolution of fish reproductive strategies and ecological adaptation. Furthermore, to investigate the differentiation cascade of hatching gland cells, we successfully generated and established multiple mutant zebrafish lines.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では孵化酵素を始めとした、孵化に関連する遺伝子の網羅的な分子進化パターンを明らかにしている。特に222魚種の全ゲノム配列を用いた網羅的な解析からあきらかになった卵保護との関連が強く示唆される遺伝子の偽遺伝子化は、水産業への応用も見込めるだけでなく、深海魚などの繁殖方法が未同定の種における非侵襲的な遺伝子マーカーとしても応用展開が見込めるものである。このように、本研究成果は脊椎動物の繁殖生態について重要な知見をもたらすだけでなく、その社会的意義も大きいものである。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Molecular evolution of patristacin genes in teleosts based on the genome survey2023

    • Author(s)
      Nakano Yuko、Nagasawa Tatsuki、Okazawa Yohei、Mashiko Naoya、Yasumasu Shigeki、Kawaguchi Mari
    • Journal Title

      Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution

      Volume: 340 Issue: 6 Pages: 414-423

    • DOI

      10.1002/jez.b.23195

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular evolution of hatching enzymes and their paralogous genes in vertebrates.2022

    • Author(s)
      Tatsuki Nagasawa, Mari Kawaguchi, Kohki Nishi, Shigeki Yasumasu
    • Journal Title

      BMC Ecology and Evolution

      Volume: 22 Issue: 1 Pages: 9-9

    • DOI

      10.1186/s12862-022-01966-2

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A transcriptomic reevaluation of the accessory olfactory organ in Bichir (Polypterus senegalus)2022

    • Author(s)
      Sakuma Atsuhiro、Zhang Zicong、Suzuki Eri、Nagasawa Tatsuki、Nikaido Masato
    • Journal Title

      Zoological Letters

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1186/s40851-022-00189-z

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Pactacin is a novel digestive enzyme in teleosts2021

    • Author(s)
      Kawaguchi M, Okazawa Y, Imafuku A, Nakano Y, Shimizu R, Ishizuka R, Jiang T, Nagasawa T, Hiroi J, Yasumasu S
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 7230-7230

    • DOI

      10.1038/s41598-021-86565-9

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      伊藤隆晃, 西浦賀乃子, 木村優希, 中牟田信明, 長澤竜樹, 二階堂雅人
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      黒瀬成美, 田中亮輔, 小林沙織, 重谷安代, 岡部正隆, 長澤竜樹, 二階堂雅人
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      第2回日本遺伝学会春の分科会
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      賈云帆,相原光人,長澤竜樹,二階堂雅人
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      賈云帆,相原光人,長澤竜樹,二階堂雅人
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  • [Presentation] マルチオミクス解析で探る「シクリッドの唇肥大化」の平行進化メカニズム2022

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      待井長敏,畑島諒,中村遥奈,丹羽達也,田口 英樹,長澤竜樹,二階堂雅人
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      長澤竜樹,相原光人,二階堂雅人
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      待井長敏, 畑島諒, 中村遥奈, 長澤竜樹, 二階堂雅人
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      大嶋理香,辰巳徳史,姫岩翔子,長澤竜樹,矢野十織,岡部正隆
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      第126回 日本解剖学会総会・全国学術集会 第98回 日本生理学会大会 合同大会
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      藤崎花美、二階堂雅人、長澤竜樹
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      長澤竜樹、安増茂樹、矢野十織、岡部正隆
    • Organizer
      日本進化学会第22回オンライン大会
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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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