• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Diversification process of photoperiodic flowering in Lemna genus

Research Project

Project/Area Number 20K15861
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
Research InstitutionKagoshima University

Principal Investigator

Muranaka Tomoaki  鹿児島大学, 農学部, 特別研究員PD (50761938)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords光周性 / 概日時計 / アオウキクサ属 / 花成 / 局所適応 / フロリゲン / トランスクリプトーム / 比較ゲノム / 概日リズム / RNA-seq / ゲノミクス
Outline of Research at the Start

植物の生活史において開花・結実は最重要イベントである。そのため、花成時期は分類学・生態学の双方に重要な形質となる。花成時期の決定要因に、概日時計を基盤とした日長計測による光周性がある。多くの分類群で、長日性(春咲き)・短日性(秋咲き)の両方が見られるが、日長応答の多様化プロセスは不明である。本研究では、古くから光周性の解析に用いられてきたアオウキクサ属のイボウキクサ(長日)・アオウキクサ(短日)の純系株についてゲノムを決定し、ゲノムから表現型まで多階層での比較解析を行う。古くて新しいモデル植物として分子遺伝学の基盤を整備し、光周性花成を中心に種分化プロセスを分子レベルで解明する。

Outline of Final Research Achievements

Flowering and fruiting are the most important events in the life history of plants. Flowering time is therefore an important trait for both taxonomy and ecology. Photoperiodism, which is based on photoperiod measurement via the circadian clock, is an important factor in determining flowering seasons. Long-day (spring-blooming) and short-day (autumn-blooming) plants are observed in various taxa, but its diversification process is still unknown. In this study, two closely related species of the genus Lemna, Lemna gibba (long-day) and Lemna aequinoctialis (short-day) were analized. These two species have been used for photoperiodic analysis for a long time. There were long-day-inducible and short-day-inducible FT genes. It was suggested that the proper use of these two genes is important for diversification fo photoperiodic resonse.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

四季の移ろいの美しさは、折々に咲く花による部分が大きい。開花季の多様化には様々な要因が複雑に絡むが、日長計測による光周性もその1つである。多くの分類群で、長日性(春咲き)・短日性(秋咲き)の両方が見られるため、進化的に光周性の逆転が起きていると考えられるが、その分子機構は不明な点が多い。本研究では、イボウキクサ(長日)・アオウキクサ(短日)という近縁の2種を用いて、光周性逆転の謎に迫った。その結果、花成ホルモンであるFT遺伝子に長日誘導型と短日誘導型の2つが存在し、その使い分けが逆転に関連することが示唆された。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] A non-cell-autonomous circadian rhythm of bioluminescence reporter activities in individual duckweed cells2023

    • Author(s)
      Watanabe Emiri、Muranaka Tomoaki、Nakamura Shunji、Isoda Minako、Horikawa Yu、Aiso Tsuyoshi、Ito Shogo、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: kiad218 Issue: 1 Pages: 677-688

    • DOI

      10.1093/plphys/kiad218

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism in the short-day plant Lemna aequinoctialis2022

    • Author(s)
      Muranaka Tomoaki、Ito Shogo、Kudoh Hiroshi、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Issue: 7 Pages: 104634-104634

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104634

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Multifunctional chemical inhibitors of the florigen activation?complex discovered by structure‐based high‐throughput screening2022

    • Author(s)
      Taoka Ken‐ichiro、Kawahara Ikumi、Shinya Shoko、Harada Ken‐ichi、Yamashita Eiki、Shimatani Zenpei、Furuita Kyoko、Muranaka Tomoaki、Oyama Tokitaka、Terada Rie、Nakagawa Atsushi、Fujiwara Toshimichi、Tsuji Hiroyuki、Kojima Chojiro
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 112 Issue: 6 Pages: 1337-1349

    • DOI

      10.1111/tpj.16008

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Detection of uncoupled circadian rhythms in individual cells of Lemna minor using a dual-color bioluminescence monitoring system2021

    • Author(s)
      Watanabe Emiri、Isoda Minako、Muranaka Tomoaki、Ito Shogo、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: - Issue: 5 Pages: 815-826

    • DOI

      10.1093/pcp/pcab037

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ウキクサ植物:花成制御多様化の古くて新しいモデル2023

    • Author(s)
      村中智明
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 短日性アオウキクサの花成限界日長が日本で多様化する理由とその分子機構2022

    • Author(s)
      村中智明、伊藤照悟、工藤洋、小山時隆
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アオウキクサ属の長日・短日植物の比較トランスクリプトーム2022

    • Author(s)
      村中智明、伊藤照悟、小山時隆
    • Organizer
      第54回種生物学会シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] アオウキクサ属における 長日植物と短日植物の 比較トランスクリプトーム2022

    • Author(s)
      村中智明、伊藤照悟、工藤洋、小山時隆
    • Organizer
      第29回時間生物学会学術大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] クロノタイプ効果による適応形質の多様化:短日植物における限界日長の局所適応2022

    • Author(s)
      村中智明, 工藤洋, 伊藤照悟, 小山時隆
    • Organizer
      第69回日本生態学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 3つの日長条件における短日性ウキクサの日周トランスクリプトーム2022

    • Author(s)
      村中智明
    • Organizer
      第63回植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Natural variation of the circadian period contributes to fine-tuning of photoperiodic flowering2021

    • Author(s)
      Tomoaki Muranaka, Hiroshi Kudoh, Tokitaka Oyama
    • Organizer
      85th Cold Spring Harbor Laboratory Symposium on Quantitative Biology Biological Time Keeping
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 局所適応におけるクロノタイプ効果:アオウキクサの開花期多様化からの検証2021

    • Author(s)
      村中智明, 伊藤照悟, 工藤洋, 小山時隆
    • Organizer
      日本進化学会第23回東京大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 局所適応におけるクロノタイプ効果:短日性アオウキクサの限界日長多様化からの検証2021

    • Author(s)
      村中智明, 伊藤照悟, 工藤洋, 小山時隆
    • Organizer
      第28回日本時間生物学会学術大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 早稲・晩稲水田におけるアオウキクサ開花フェノロジー2021

    • Author(s)
      村中智明
    • Organizer
      第53回種生物学シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Monitoring cellular circadian rhythms in an intact plant2020

    • Author(s)
      村中智明 小山時隆
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 冷たい世界で時を刻むものは何か2020

    • Author(s)
      村中智明、本庄三恵、川越哲博、 永野惇、工藤洋
    • Organizer
      第27回日本時間生物学会学術大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 日本産アオウキクサの集団内・集団間における形質相関2020

    • Author(s)
      村中智明、工藤洋、小山時隆
    • Organizer
      第52回種生物学シンポジウム
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi