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Reaction mechanism and regulation of the same-site multistep oxidative cytochrome P450 enzymes involved in natural product biosynthesis

Research Project

Project/Area Number 20K16034
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 47050:Environmental and natural pharmaceutical resources-related
Research InstitutionToho University

Principal Investigator

Iizaka Yohei  東邦大学, 薬学部, 講師 (40770425)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
KeywordsシトクロムP450酵素 / 多機能型P450酵素 / 生合成 / マクロライド系抗生物質 / 結晶構造解析 / 多段階酸化型P450 / 反応制御 / 天然物 / 天然物生合成
Outline of Research at the Start

シトクロムP450酵素(P450)RosCはマクロライド系抗生物質rosamicinの生合成に関与し、抗菌活性に影響する基質の同一部位を3段階酸化修飾する。一般的なP450は基質を一回のみ酸化修飾するが、RosCは如何にして多段階の酸化修飾を可能とするのか。そのメカニズムは大変興味深い。また、複数回の酸化反応は化学構造の多様化を導くが、目的物質の選択的且つ効率的な生産という側面では反応を制御することが重要な課題となる。
そこで、野生型RosCと特定の酸化反応のみを触媒する変異体の酵素反応速度論的解析と立体構造解析によるアプローチから多段階酸化型P450に関する新たな知見を得る。

Outline of Final Research Achievements

Multifunctional cytochrome P450 enzymes, which catalyze multistep oxidation reactions, are advantageous for diversifying the structure and bioactivity of compounds because a single enzyme can carry out multiple structural modifications. In this study, we focused on P450 RosC, which iteratively oxidize a single site in a substrate during the biosynthesis of the macrolide. Comparative analysis of the substrate affinity and X-ray crystal structure between the wild type and a mutant that catalyzes only the first oxidation reaction revealed some of the factors that enable and regulate the multistep oxidative modification reaction.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

野生型RosCと変異体の結晶構造解析により多段階酸化修飾に重要なP450の立体構造を見出すことが出来た。本結果は、多機能型P450を目的の反応だけ触媒するように制御できる可能性を示し、工業的にも重要な多機能型P450を利用した目的物質の選択的且つ効率的な生産に貢献することが期待される。また、、本成果に基づいて基質を1回のみ酸化修飾する大多数のP450を多機能型P450へと機能改変することで、新たな有用物質の創出にも繋がる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Engineering sequence and selectivity of late-stage C-H oxidation in the MycG iterative cytochrome P4502021

    • Author(s)
      Iizaka, Y., Arai, R., Takahashi, A., Ito, M., Sakai, M., Fukumoto, A., Sherman, D. H., Anzai, Y.
    • Journal Title

      Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology

      Volume: 49 Issue: 1

    • DOI

      10.1093/jimb/kuab069

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An overview of the cytochrome P450 enzymes that catalyze the same-site multistep oxidation reactions in biotechnologically relevant selected actinomycete strains2021

    • Author(s)
      Iizaka Yohei、Sherman David H.、Anzai Yojiro
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology

      Volume: 105 Issue: 7 Pages: 2647-2661

    • DOI

      10.1007/s00253-021-11216-y

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 放線菌由来の多段階型・多機能型シトクロムP450酵素に関する研究2022

    • Author(s)
      飯坂洋平
    • Organizer
      第36回日本放線菌学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] シトクロムP450酵素MycGの反応制御に基づく希少な生合成中間体の効率的な生産2021

    • Author(s)
      飯坂洋平, 伊藤みき乃, 酒井美穂, 澤井香奈子, 山田茉莉, 福本敦, 安齊洋次郎
    • Organizer
      第33回微生物シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 分光学的手法による多段階酸化型シトクロムP450酵素RosCの機能解析2021

    • Author(s)
      飯坂洋平, 齊藤咲季, 島野美衣, 緒方美梨, 福本敦, 安齊洋次郎
    • Organizer
      2021年度 日本放線菌学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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