Project/Area Number |
20K16194
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 49020:Human pathology-related
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Research Institution | Nagasaki University |
Principal Investigator |
黒田 揮志夫 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 助教 (10772808)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2022: ¥260,000 (Direct Cost: ¥200,000、Indirect Cost: ¥60,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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Keywords | 肺腺癌 / 浸潤性粘液腺癌 / 非浸潤性粘液腺癌 / 肺浸潤性粘液腺癌 / 肺非粘液腺癌 / 次世代シークエンサー / 機械学習 |
Outline of Research at the Start |
浸潤性粘液腺癌は、頻度は低いが、時に肺内転移をきたす予後不良の肺癌の一つである。病理組織学的に、多量の粘液を細胞内に産生すると定義されているが、杯細胞や円柱上皮で構成されるなど多彩な組織型を取ることが知られている。新規の亜型であることから、免疫染色や遺伝子学的特徴が十分に整理されていない。我々は、予後決定因子と考えられている免疫染色(HNF4a)の発現を調べ、次世代シークエンサーにより網羅的遺伝子解析を行う。これらの免疫組織化学的特徴と遺伝子情報により、浸潤性粘液腺癌の生物学的特徴を明らかにし、その他の肺腺癌亜型との相違を分析することで、分子病理学的腺癌分類の再構築を試み悪性度の層別化を行う。
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Outline of Annual Research Achievements |
まずは長崎大学の約50症例を用いてHNF4αとTTF-1/Napsin Aの免疫染色を実施した。その結果、TTF-1/Napsin AとHNF4αには排他的な染色関係があることを発見した。また、その中でも10例において、両方の染色が混在している症例があることを発見した。これらには、通常の肺腺癌のなかでもAcinar subtypeのものが多く観察された。それらの周囲にはlepidicのcomponentが含まれないものが多く存在した。 これは、lepidicからacinarに移行するtransformationと、Invasive mucinous adenocarcinomaにtransformationする症例の分子的背景が異なる可能性を示している。 これを受け、lepidic componentからacinarに移行する症例7例のacinarとlepidicの部位(合計14か所)を切り出し、RNA シーケンスを実施し、さらにInvasive mucinous adenocarcinomaとacinar adenocarcinomaが混在する2症例のそれぞれの部位(合計4か所)、およびpureなinvasive mucinous adenocarcinomaの症例2例の合計20部位についてRNAシーケンスを実施した。 しかし、解析データには多い量のアダプターダイマーが含まれており、ライブラリーのピークが低くなってしまっていた。アダプターダイマーの除去など別途必要なステップが生じたため、解析に時間がかかっている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
解析データには多い量のアダプターダイマーが含まれており、ライブラリーのピークが低くなってしまっていた。アダプターダイマーの除去など別途必要なステップが生じたため、解析に時間がかかっている。
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Strategy for Future Research Activity |
解析データにおける、多い量のアダプターダイマーが含まれており、ライブラリーのピークが低くなってしまっていた。現在、アダプターダイマーの除去など別途必要なステップを再構築しており、再構築は順調である。6月にはデータが出そろう予定である。
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