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Whole-body/organ pathology of cancer microenvironment

Research Project

Project/Area Number 20K16212
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 49030:Experimental pathology-related
Research InstitutionHokkaido University (2021)
The University of Tokyo (2020)

Principal Investigator

Kubota Shimpei  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 特任講師 (90808859)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords全身全細胞解析 / システム生物学 / がん微小環境 / 組織透明化 / がん転移 / 癌転移 / シングルセルバイオロジー
Outline of Research at the Start

がんの持つ時空間的な多様性を解明するために、申請者らが開発してきた全身全細胞を1細胞解像度で網羅的に観察するための組織透明化技術および大容量画像の解析技術を発展応用させることにより“がんの三次元病理解析基盤の確立”を目指す。確立した基盤技術を担がんモデルマウスに対して展開することで、がんの発生から治療による根治もしくは治療抵抗性の獲得による再発・転移まで、時系列的にがん微小環境における相互作用のダイナミクスを定量的に解明することが可能となる。本技術はがん微小環境の制御による新規医療技術シーズの創出・検証に繋がると考えている。

Outline of Final Research Achievements

Tissue clearing is one of the most powerful strategies for a comprehensive analysis of disease progression. In this project, we established an integrated pipeline that combines tissue clearing, 3D imaging, and machine learning and applied to a mouse tumour model of experimental lung metastasis using human lung adenocarcinoma A549 cells. This pipeline provided the spatial information of the tumour microenvironment. We further explored the role of transforming growth factor-β (TGF-β) in cancer metastasis. TGF-β-stimulated cancer cells enhanced metastatic colonization of unstimulated-cancer cells in vivo when both cells were mixed. Further, whole-organ analysis revealed accumulation of platelets or macrophages with TGF-β-stimulated cancer cells, suggesting that TGF-β might promote remodelling of the tumour microenvironment, enhancing the colonization of cancer cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

今回の研究では、これまでに樹立した簡便な組織透明化手法の開発に、機械学習による画像解析を組み合わせることで、がん微小環境内における細胞間相互作用の解析基盤を構築しました。本解析手法を用いることで TGF-beta刺激をうけたがん細胞が、TGF-beta刺激をうけていないがん細胞にも影響を与えてがん細胞の転移巣形成を促進するという、TGF-betaの新たな作用を明らかにしました。これらの発見は、がん微小環境における細胞間相互作用によるがん転移促進機構と、そのメカニズムを担う分子のがん治療標的としての可能性について有益な示唆をもたらしました。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] ワシントン大学(米国)

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Journal Article] Whole-organ analysis of TGF-β-mediated remodelling of the tumour microenvironment by tissue clearing.2021

    • Author(s)
      Kubota SI, Takahashi K, Mano T, Matsumoto K, Katsumata T, Shi S, Tainaka K, Ueda HR, Ehata S, Miyazono K.
    • Journal Title

      Commun. Biol.

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: 294-294

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01786-y

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Visualization of the cancer cell cycle by tissue-clearing technology using the Fucci reporter system.2021

    • Author(s)
      Kei Takahashi, Ryo Tanabe, Shogo Ehata, Shimpei I Kubota, Yasuyuki Morishita, Hiroki R Ueda, Kohei Miyazono
    • Journal Title

      Cancer science

      Volume: 112 Issue: 9 Pages: 3796-3809

    • DOI

      10.1111/cas.15034

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Heterogenous expression of endoglin marks advanced renal cancer with distinct tumor microenvironment fitness.2021

    • Author(s)
      Yusaku Momoi, Jun Nishida, Kosuke Miyakuni, Masafumi Kuroda, Shimpei I Kubota, Kohei Miyazono, Shogo Ehata
    • Journal Title

      Cancer science

      Volume: 112 Issue: 8 Pages: 3136-3149

    • DOI

      10.1111/cas.15007

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 三次元病理解析に資する組織透明化手法の開発2021

    • Author(s)
      久保田晋平、高橋恵生、田井中一貴、江幡正悟、上田泰己、宮園浩平
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Whole-organ quantitative analysis of the tumor microenvironment by tissue clearing2021

    • Author(s)
      Kubota Shimpei I.、Takahashi Kei、Mano Tomoyuki、Matsumoto Katsuhiko、Katsumata Takahiro、Shi Shoi、Tainaka Kazuki、Ueda Hiroki R.、Ehata Shogo、Miyazono Kohei
    • Organizer
      第93回日本薬理学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Whole-organ quantitative analysis of cancer metastasis with single cell resolution2020

    • Author(s)
      Kubota Shimpei I.、Takahashi Kei、Nishida Jun、Ehata Shogo、Miyazono Kohei
    • Organizer
      第79回日本癌学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Book] シングルセル解析でなにがわかるか2020

    • Author(s)
      久保田晋平 他多数
    • Total Pages
      200
    • Publisher
      化学同人
    • ISBN
      9784759817348
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] TGF-betaを介したがん微小環境リモデリング機構の発見

    • URL

      https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/articles/z0508_00103.html

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Research-status Report
  • [Remarks] がん転移並びに抗がん剤耐性メカニズムの解明に有用なイメージング手法を確立

    • URL

      https://www.m.u-tokyo.ac.jp/news/admin/release_20210708.pdf

    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2023-01-30  

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