| Project/Area Number |
20K16440
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
|
|---|
| Research Institution | Kanazawa University (2022)
Osaka University (2020-2021) |
|---|
Principal Investigator |
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
|
| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
|
|---|
| Keywords | ELF3 / ATAC-seq / CUT&Tag / スーパーエンハンサー / ASCL1 / 肺小細胞癌 / マスター転写因子 / 個別化医療 / エピゲノム / エピジェネティクス |
|---|
| Outline of Research at the Start |
肺小細胞癌（SCLC：small cell lung cancer）は悪性度の高い難治性癌であり、約30年間治療法が殆ど進歩していない。近年ではマスター転写因子の発現および転写制御パターンによる癌のサブグループ化の臨床的妥当性が示され、予後や治療応答性との関連が明らかにされてきている。申請者はマスター転写因子に基づいたSCLCの類型化について解析を行ってきた。本研究ではSCLCにおけるマスター転写因子ELF3に注目し、その機能および転写制御メカニズムの全貌を明らかにし、さらにELF3の病的意義やバイオマーカーとしての有用性を検討する。
|
| Outline of Final Research Achievements |
Using 3 ELF3 high-expression cell lines, we conducted open chromatin analysis by ATAC-seq and comprehensive histone modification analysis by CUT&Tag. We discovered that ELF3 functions as a super-enhancer-associated transcription factor in ASCL1-type small cell lung cancer (SCLC). Furthermore, we performed CUT&Tag using anti-ELF3 antibody and KD-RNA-seq using siRNA to list the target genes of ELF3. Pathway analysis of the ELF3-target genes suggested their involvement in cell survival and the cell cycle, which was confirmed by cell proliferation assays and cell cycle analysis using siRNA.
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
ELF3はASCL1型のSCLCではスーパーエンハンサー関連転因子として腫瘍促進的な役割を果たすことが示された。ELF3は膀胱癌や十二指腸癌ではがん抑制遺伝子として働いており、がん抑制促進の２面性を持つcontext-dependentな転写因子であることが本研究により明らかになった。
|
