| Project/Area Number |
20K16600
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 52020:Neurology-related
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
Ogawa Kotaro 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (80870500)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
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| Keywords | ゲノムワイド関連解析 / メンデルランダム化解析 / 多発性硬化症 |
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| Outline of Research at the Start |
ゲノムワイド関連解析(GWAS)の広まりにより形質に有意な関連を持つ1塩基多型を操作変数として関連解析を行うメンデルランダム化解析が行われるようになっている。今回我々は多発性硬化症患者400名、健常者400名のGWASを実施する。次に、多発性硬化症のGWAS結果と、日本人における約60形質の大規模GWASデータを用いてメンデルランダム化解析を実施し、多発性硬化症発症の要因となる形質の網羅的な同定を行う。さらに欧米人GWASデータを用いて同様の解析を実施し、両人種間の多発性硬化症発症リスク因子を比較する。
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| Outline of Final Research Achievements |
We studied a total of 605 patients with multiple sclerosis of Japanese ancestry and 50,484 controls. The genetic variant in the major-histocompatibility-complex (MHC) region was associated with the disease with a genome-wide significance, which has been reported in Europeans. We then conducted a trans-ethnic genome-wide association study using the results of IMSGC GWAS summary statistics. No novel associations were found in this study. We conducted a GWAS study including 220 patients with neuromyelitis optica spectrum disorder and 50,484 controls. In addition to the MHC region, we identified a novel association region in CCR6 on chromosome 6.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
日本人多発性硬化症、視神経脊髄炎における過去最大のゲノムワイド関連解析を実施した。多発性硬化症では欧米人同様MHC領域が最も強い関連を有し、人種を超えて同領域が疾患の発症に重要であることが示された。視神経脊髄炎については新規の疾患感受性遺伝子であるCCR6を同定した。CCR6はIL17産生T細胞に発現することが知られており、IL17産生T細胞と視神経脊髄炎発症との関連が示唆された。今回はコントロールサンプル重複の問題があり、既存のメンデルランダム化解析手法では形質と疾患の間で正確な因果関係の推定が困難であった。サンプル重複の補正が可能なメンデルランダム化解析手法の開発の必要性が示された。
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