| Project/Area Number |
20K16620
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 52030:Psychiatry-related
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
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| Keywords | 統合失調症 / 分子遺伝学 / 体細胞変異 / 高深度全エクソーム解析 |
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| Outline of Research at the Start |
我々は、統合失調症患者と両親からなる40組について、ゲノム中のすべてのエクソン（全エクソーム）の塩基配列を解読（シーケンス）する全エクソーム解析を行い、両親には存在せず患者で新たに生じたde novoの非同義変異を17個同定している。本研究では、この成果を発展させ、①高深度の全エクソーム解析、②高深度のターゲットシーケンスという2つの手法を組みわせることにより、統合失調症の発症に大きな効果を持つ体細胞変異を同定する。本研究で得られる成果を基盤として、統合失調症の病態解明や根本的治療法の開発に結び付けることが最終目標である。
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| Outline of Final Research Achievements |
Among the DNA samples collected from 60 families with schizophrenia patients and their parents, we performed high-depth (346±96) whole exome analysis on the DNA samples of schizophrenia patients using a next-generation sequencer (NovaSeq6000). Using the parent's whole exome data (normal depth) as a reference, the patient's whole exome data (high depth and normal depth) were searched for somatic mutations, and 115 somatic mutations were detected. Of these, 28 somatic mutations were subjected to ultra-deep (average depth 79,940) targeted sequencing using a next-generation sequencer. Primers were designed for ultra-deep targeted sequencing of the remaining 87 somatic mutations.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究の目的は、統合失調症の発症に大きな効果を持つ体細胞変異を同定し、その病態解明および根本的な治療法開発の分子基盤を得ることである。体細胞変異が精神疾患の病態に関与している可能性が示唆されているが、これまで体細胞変異の検出は困難であった。本研究では、統合失調症患者・両親トリオを用いて、高深度の全エクソーム解析を行い体細胞変異の検索を行った。この研究を発展させ統合失調症の発症に大きな効果を持つ体細胞変異が同定されれば、その病態解明へと結びつけることが可能となる。
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