肝細胞不均一性に着目した慢性肝疾患の病態進行と発がん機構の解明
| Project/Area Number |
20K17038
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
|
|---|
| Research Institution | National Center for Global Health and Medicine |
|---|
Principal Investigator |
山添 太士 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 肝炎・免疫研究センター, 肝疾患研究部 上級研究員 (20736219)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
|
| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
|
|---|
| Keywords | 細胞核画像解析 / 慢性肝疾患 / 空間的遺伝子解析 / シングルセル 調製法 / ヘテロ不均一 / 発がん |
|---|
| Outline of Research at the Start |
マウスなどの実験動物に対する肝細胞のploidyに関する研究は散見されるものの、ヒトの生理学的な染色体量のheterogeneityや慢性肝障害時におけるploidyの変化や、その病態特異性・依存性は未だ明らかになっていない。本研究では、これまで検討されてなかったzonationおよび肝細胞倍数性の両面から、肝細胞群のheterogeneityに関して検討を加えるとともに、B型・C型肝炎ウイルス、アルコール性、非アルコール性脂肪性肝疾患など癌病変の素地となる慢性肝疾患横断的な検討を行うことで新たな知見を得ようとするものである。
|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、肝細胞のヘテロ不均一性(heterogeneity)に着目した新規解析法を用いて、肝細胞癌患者の切除肝標本の非癌部ならびに癌部を解析し、染色体量(ploidy)の変化と慢性肝障害の進行や発癌との関連を解明することで、その病態進行の機序を明らかにすることを目的とする。これまで、転移性肝癌切除標本の非癌部を慢性肝障害のないコントロール群としてploidyとzonationの関連性の評価のために、非アルコール性脂肪性肝疾患の非癌部を5例、直腸癌の転移性肝がんの非癌部を5例解析した。2年目はさらに空間的遺伝子解析としてVISIUMを利用し、新たに4例の非アルコール性脂肪性肝疾患の非癌部の手術標本の新鮮凍結切片を用いたが、遺伝子品質にばらつきが大きく、通常のt-SNE解析に加えて、組織切片上で門脈域の線維化をランドマークとして遺伝子解析スポットの各距離を変数としてclusteringを行なったが特徴的な遺伝子群は見出せなかった。3年目は、パラフィン標本を用いたVISIUMを用いた解析を10例行なった。凍結切片を用いたVISIUMにくらべてサンプル品質に堅牢なシステムであった。一方、これまでシングルセル解析を行うために慢性肝疾患モデルマウスの肝組織を用いてサンプル調製法をいくつか試行したものの、慢性障害肝細胞とくに脂肪性肝炎モデルにおける肝細胞の分取においては細胞の肥大と物理刺激に脆弱なためコラゲナーゼあるいはリベラーゼ処理では容易に細胞膜が破壊され核のみ単離される状態となった。シングルセルと同様にシングル核RNA-seq解析をおこなうこともできるが、現状では元となる細胞が２あるいは多核肝細胞か単核の肝細胞かを類推する方法がないためシングルセル解析は施行できなかった。
|
Report
(4 results)
Research Products
(22 results)
-
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Sphingosine‐1‐phosphate promotes tumor development and liver fibrosis in mouse model of congestive hepatopathy2021
Author(s)
Kawai H, Osawa Y, Matsuda M, Tsunoda T, Yanagida K, Hishikawa D, Okawara M, Sakamoto Y, Shimagaki T, Tsutsui Y, Yoshida Y, Yoshikawa S, Hashi K, Doi H, Mori T, Yamazoe T, Yoshio S, Sugiyama M, Okuzaki D, Komatsu H, Inui A, Tamura-Nakano M, Oyama C, Shindou H, Kusano H, Kage M, Ikegami T, Yanaga K, Kanto T
-
Journal Title
Hepatology
Volume: -
Issue: 1
Pages: 112-125
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Mutant p53 regulates Survivin to foster lung metastasis2021
Author(s)
Tang Q.、Efe G.、Chiarella A.、Leung J.、Chen M.、Yamazoe T.、Su Z.、Pitarresi J.、Li J.、Islam M.、Karakasheva T.、Klein-Szanto A.、Pan S.、Hu J.、Natsugoe S.、Gu W.、Stanger B.、Wong K.、Diehl A.、Bass A.、Nakagawa H.、Murphy M.、Rustgi A.
-
Journal Title
Genes & Development
Volume: 35
Issue: 7-8
Pages: 528-541
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
-
-
-
